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PLANT PRIMERS
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| Peperomia cubensis (AF029783) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Coffea arabica (AJ247586) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Linum sp ((AJ247604) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Musa nana (AJ247609) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Beta vulgaris (X57693) | A | T | G | A | C | A | A | A | T | C | T | G | G | T | T | C | G | A | T | G | G | C | T | G | T | T | C | T | C | T | A | C | T | A | A | C | C | A | C | A | A | G | G | A | T | A | T | A | G | G | G | A | C | T | C | T | C | T | A | T | T | T | C | A | T | C | T | T | C | G | G | T | G | C | C | A | T | T | G | C | T | G | G | A | G | T | G | A | T | G | G | G | C | A | C | A | T | G | C | T |
| Betula papyrifera (U77620) | A | C | G | A | C | A | A | A | T | C | C | G | G | T | C | C | G | A | T | G | G | C | T | G | T | T | C | T | C | C | A | C | T | A | A | C | C | A | C | A | A | G | G | A | T | A | T | A | G | G | G | A | C | T | C | T | A | T | A | T | T | T | C | A | T | C | T | T | C | G | G | T | G | C | C | A | T | T | G | C | T | G | G | A | G | T | G | A | T | G | G | G | C | A | C | A | T | G | C | T |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Chamaerops humilis (U77621) | A | T | G | A | C | A | A | A | T | C | C | G | G | T | C | C | G | A | T | G | G | C | T | G | T | T | C | T | C | C | A | C | T | A | A | C | C | A | C | A | A | G | G | A | T | A | T | C | G | G | T | A | C | T | C | T | A | T | A | T | T | T | C | A | T | C | T | T | C | A | G | T | G | C | C | A | T | T | G | C | T | G | G | A | G | T | G | A | T | G | G | G | C | A | C | A | T | G | C | T |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Magnolia stellata (U77622) | A | C | G | A | C | A | A | A | T | C | C | G | G | T | C | C | G | A | T | G | G | C | T | G | T | T | C | T | C | C | A | C | T | A | A | C | C | A | C | A | A | G | G | A | T | A | T | A | G | G | G | A | C | T | C | T | C | T | A | T | T | T | C | A | T | C | T | T | C | G | G | T | G | C | C | A | T | T | G | C | T | G | G | A | G | T | G | A | T | G | G | G | C | A | C | A | T | G | C | T |
| Pisum sativum (X1440) | A | T | G | A | C | A | A | A | T | C | C | G | G | T | C | C | G | A | T | G | G | C | T | G | T | T | C | T | C | C | A | C | T | A | A | C | C | A | C | A | A | G | G | A | T | A | T | A | G | G | G | A | C | T | C | T | A | T | A | T | T | T | C | A | T | C | T | T | C | G | G | T | G | C | C | A | T | T | G | C | T | G | G | A | G | T | G | A | T | G | G | G | C | A | C | A | T | G | C | T |
| Piper bicolor (AY009448) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Populus tremuloides (U77623) | A | T | G | A | C | A | A | A | T | C | C | G | G | T | C | C | G | A | T | G | G | C | T | G | T | T | C | T | C | C | A | C | T | A | A | C | C | A | C | A | A | G | G | A | T | A | T | C | G | G | T | A | C | T | C | T | A | T | A | T | T | T | C | A | T | C | C | T | C | A | G | T | G | C | C | A | T | T | G | C | T | G | G | A | G | T | G | A | T | G | G | G | C | A | C | A | T | G | C | T |
| Solanum tuberosum (AF096321) | A | C | G | A | C | A | A | A | T | C | C | G | G | T | C | C | G | A | T | G | G | C | T | G | T | T | C | T | C | C | A | C | T | A | A | C | C | A | C | A | A | G | G | A | T | A | T | A | G | G | G | A | C | T | C | T | T | T | A | T | T | T | C | A | T | C | T | T | C | G | G | T | G | C | C | A | T | T | G | C | T | G | G | A | G | T | G | A | T | G | G | G | C | A | C | A | T | G | C | T |
| Oryza sativa (X15990) | - | T | G | A | C | A | A | A | T | C | T | G | G | T | C | C | G | A | T | G | G | C | T | C | T | T | C | T | C | C | A | C | T | A | A | C | C | A | C | A | A | G | G | A | T | A | T | C | G | G | T | A | C | T | C | T | A | T | A | T | T | T | C | A | T | C | T | T | C | G | G | T | G | C | C | A | T | T | G | C | A | G | G | A | G | T | G | A | T | G | G | G | C | A | C | A | T | G | C | T |
| Sabel palmetto (U77624) | A | T | G | A | C | A | A | A | T | C | C | G | G | T | C | C | G | A | T | G | G | C | T | G | T | T | C | T | C | C | A | C | T | A | A | C | C | A | C | A | A | G | G | A | T | A | T | C | G | G | T | A | C | T | C | T | A | T | A | T | T | T | C | A | T | C | C | T | C | A | G | T | G | C | C | A | T | T | G | C | T | G | G | A | G | T | G | A | T | G | G | G | C | A | C | A | T | G | C | T |
| Glycine max (M16884) | A | T | G | A | C | A | A | A | T | C | C | G | G | T | C | C | G | A | T | G | G | C | T | G | T | T | C | T | C | C | A | C | T | A | A | C | C | A | C | A | A | G | G | A | T | A | T | A | G | G | G | A | C | T | C | T | A | T | A | T | T | T | C | A | T | C | T | T | C | G | G | T | G | C | C | A | T | T | G | C | T | G | G | A | G | T | G | A | T | G | G | G | C | A | C | A | T | G | C | T |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | A | C | G | A | C | A | A | A | T | C | C | G | G | T | C | C | G | A | T | G | G | C | T | G | T | T | C | T | C | C | A | C | T | A | A | C | C | A | C | A | A | G | G | A | T | A | T | A | G | G | G | A | C | T | C | T | T | T | A | T | T | T | C | A | T | C | T | T | C | G | G | T | G | C | C | A | T | T | G | C | T | G | G | A | G | T | G | A | T | G | G | G | C | A | C | A | T | G | C | T |
| Triticum aestivum (Y00417) | A | T | G | A | C | A | A | A | T | A | T | G | G | T | T | C | G | A | T | G | G | C | T | C | T | T | C | T | C | T | A | C | T | A | A | C | C | A | C | A | A | G | G | A | T | A | T | T | G | G | G | A | C | T | C | T | C | T | A | T | T | T | C | A | T | C | T | T | C | G | G | T | G | C | C | A | T | T | G | C | A | G | G | A | G | T | G | A | T | G | G | G | C | A | C | A | T | G | C | T |
| Zea mays (X02660) | A | T | G | A | C | A | A | A | T | C | T | G | G | T | C | C | G | A | T | G | G | C | T | C | T | T | C | T | C | C | A | C | T | A | A | C | C | A | C | A | A | G | G | A | T | A | T | C | G | G | T | A | C | T | C | T | A | T | A | T | T | T | C | A | T | C | T | T | C | G | G | T | G | C | C | A | T | T | G | C | A | G | G | A | G | T | G | A | T | G | G | G | C | A | C | A | T | G | C | T |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | G | G | A | G | T | G | A | T | G | G | G | C | A | C | A | T | G | C | T |
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| Peperomia cubensis (AF029783) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Coffea arabica (AJ247586) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | T | T | T | A | T | A | A | T | G | T | T | T | T | A | A | T | A | A | C | G | G | C | T | C | A | C | G | C | T | T | T | T | T | T |
| Linum sp ((AJ247604) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | T | T | T | A | T | A | A | T | G | T | T | T | T | A | A | T | A | A | C | G | G | C | T | C | A | C | G | C | T | T | T | T | T | T |
| Musa nana (AJ247609) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | T | T | T | A | T | A | A | T | G | T | G | T | T | A | A | T | A | A | C | G | G | C | T | C | A | C | G | C | T | T | C | T | T | T |
| Beta vulgaris (X57693) | T | T | T | C | A | G | T | A | C | T | G | A | T | T | C | G | T | A | T | G | G | A | A | T | T | A | G | C | A | C | G | A | C | C | C | G | G | C | G | A | C | C | A | A | A | T | T | C | T | T | G | G | T | G | G | A | A | A | T | C | A | T | C | A | A | C | T | T | T | A | T | A | A | T | G | T | T | T | T | A | A | T | A | A | C | G | G | C | T | C | A | C | G | C | T | T | T | T | T | T |
| Betula papyrifera (U77620) | T | C | T | C | A | G | T | A | C | T | G | A | T | T | C | G | T | A | T | G | G | A | A | T | T | A | G | C | A | C | G | A | C | C | C | G | G | C | G | A | T | C | A | A | A | T | T | C | T | T | G | G | T | G | G | G | A | A | T | C | A | T | C | A | A | C | T | T | T | A | T | A | A | T | G | T | T | T | T | A | A | T | A | A | C | G | G | C | T | C | A | C | G | C | T | T | T | T | T | T |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | A | T | A | A | T | G | T | T | T | T | A | A | T | A | A | C | G | G | C | T | C | A | T | G | C | T | T | T | T | T | T |
| Chamaerops humilis (U77621) | T | A | T | C | A | G | T | A | C | T | G | A | T | T | C | G | T | A | T | T | G | A | A | T | T | A | G | C | C | C | G | A | C | C | C | G | G | C | G | A | T | C | A | A | A | T | T | C | T | T | G | G | T | G | G | G | A | A | T | C | A | T | C | A | A | C | T | T | T | A | T | A | A | T | G | T | T | T | T | A | A | T | A | A | C | G | G | C | T | C | A | C | G | C | T | T | C | T | T | T |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | - | - | - | C | A | G | T | A | C | T | G | A | T | T | C | G | T | A | T | G | G | A | A | T | T | A | G | C | A | C | G | A | C | C | C | G | G | C | G | A | T | C | A | A | A | T | T | C | T | T | G | G | T | G | G | G | A | A | T | C | A | T | C | A | A | C | T | T | T | A | T | A | A | T | G | T | T | T | T | A | A | T | A | A | C | G | G | C | T | C | A | C | G | C | T | C | C | T | T | T |
| Magnolia stellata (U77622) | T | C | T | C | A | G | T | A | C | T | G | A | T | T | C | G | T | A | T | G | G | A | A | T | T | A | G | C | A | C | G | A | C | C | C | G | G | C | G | A | T | C | A | A | A | T | T | C | T | T | G | G | T | G | G | G | A | A | T | C | A | T | C | A | A | C | T | T | T | A | T | A | A | T | G | T | T | T | T | A | A | T | A | A | C | G | G | C | T | C | A | C | G | C | T | C | C | T | T | T |
| Pisum sativum (X1440) | T | C | T | C | A | G | T | A | T | T | G | A | T | T | C | G | T | A | T | G | G | A | A | T | T | A | G | C | A | C | G | A | C | C | C | G | G | C | G | A | T | C | A | A | A | T | T | C | T | T | G | G | T | G | G | G | A | A | T | C | A | T | C | A | A | C | T | T | T | A | T | A | A | T | G | T | T | T | T | A | A | T | A | A | C | G | G | C | T | C | A | C | G | C | T | T | T | T | T | T |
| Piper bicolor (AY009448) | - | - | - | C | A | G | T | A | C | T | G | A | T | T | C | G | T | A | T | G | G | A | A | T | T | A | G | C | A | C | G | A | C | C | C | G | G | C | G | A | T | C | A | A | A | T | T | C | T | T | G | G | T | G | G | G | A | A | T | C | A | T | C | A | A | C | T | T | T | A | T | A | A | T | G | T | T | T | T | A | A | T | A | A | C | G | G | C | T | C | A | C | G | C | T | T | T | T | T | T |
| Populus tremuloides (U77623) | T | C | T | C | A | G | T | A | C | T | G | A | T | T | C | G | T | A | T | G | G | A | A | T | T | A | G | C | A | C | G | A | C | C | C | G | G | C | G | A | T | C | A | A | A | T | T | C | T | T | G | G | T | G | G | G | A | A | T | C | A | T | C | A | A | C | T | T | T | A | T | A | A | T | G | T | T | T | T | A | A | T | A | A | C | G | G | C | T | C | A | C | G | C | T | T | T | T | T | T |
| Solanum tuberosum (AF096321) | T | C | T | C | A | G | T | A | C | T | G | A | T | T | C | G | T | A | T | G | G | A | A | T | T | A | G | C | A | C | G | A | C | C | C | G | G | C | G | A | T | C | A | A | A | T | T | C | T | T | G | G | T | G | G | G | A | A | T | C | A | T | C | A | A | C | T | T | T | A | T | A | A | T | G | T | T | T | T | A | A | T | A | A | C | G | G | C | T | C | A | C | G | C | C | T | T | T | T | T |
| Oryza sativa (X15990) | T | C | T | C | C | G | T | A | C | T | G | A | T | T | C | G | T | A | T | G | G | A | A | T | T | A | G | C | C | C | G | A | C | C | C | G | G | C | G | A | T | C | A | A | A | T | T | C | T | T | G | G | T | G | G | G | A | A | T | C | A | T | C | A | A | C | T | T | T | A | T | A | A | T | G | T | T | T | T | A | A | T | A | A | C | G | G | C | T | C | A | C | G | C | T | T | T | T | T | T |
| Sabel palmetto (U77624) | T | C | T | C | A | G | T | A | C | T | G | A | T | T | C | G | T | A | T | T | G | A | A | T | T | A | G | C | C | C | G | A | C | C | C | G | G | C | G | A | T | C | A | A | A | T | T | C | T | T | G | G | T | G | G | G | A | A | T | C | A | T | C | A | A | C | T | T | T | A | T | A | A | T | G | T | T | T | T | A | A | T | A | A | C | G | G | C | T | C | A | C | G | C | T | T | C | T | T | T |
| Glycine max (M16884) | T | C | T | C | C | G | T | A | T | T | G | A | T | T | C | G | T | A | T | G | G | A | A | T | T | A | G | C | A | C | G | A | C | C | C | G | G | C | G | A | T | C | A | A | A | T | T | C | T | T | G | G | T | G | G | G | A | A | T | C | A | T | C | A | A | C | T | T | T | A | T | A | A | T | G | T | T | T | T | A | A | T | A | A | C | C | G | G | T | C | A | C | G | C | T | T | T | T | T | T |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | T | C | T | C | A | G | T | A | C | T | G | A | T | T | C | G | T | A | T | G | G | A | A | T | T | A | G | C | A | C | G | A | C | C | C | G | G | C | G | A | T | C | A | A | A | T | T | C | T | T | G | G | T | G | G | G | A | A | T | C | A | T | C | A | A | C | T | T | T | A | T | A | A | T | G | T | T | T | T | A | A | T | A | A | C | G | G | C | T | C | A | C | G | C | T | T | T | T | T | T |
| Triticum aestivum (Y00417) | T | C | T | C | C | G | T | A | C | T | G | A | T | T | C | G | T | A | T | G | G | A | A | T | T | A | G | C | C | C | G | A | C | C | C | G | G | C | G | A | T | C | A | A | A | T | T | C | T | T | G | G | T | G | G | G | A | A | T | C | A | T | C | A | A | C | T | T | T | A | T | A | A | T | G | T | T | T | T | A | A | T | A | A | C | G | G | C | T | C | A | T | G | C | T | T | T | T | T | T |
| Zea mays (X02660) | T | C | T | C | C | G | T | A | C | T | G | A | T | T | C | G | T | A | T | G | G | A | A | T | T | A | G | C | C | C | G | A | C | C | C | G | G | C | G | A | T | C | A | A | A | T | T | C | T | T | G | G | T | G | G | G | A | A | T | C | A | T | C | A | A | C | T | T | T | A | T | A | A | T | G | T | T | T | T | A | A | T | A | A | C | G | G | C | T | C | A | C | G | C | T | T | T | T | T | T |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sites 201 through 300
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| Peperomia cubensis (AF029783) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Coffea arabica (AJ247586) | A | A | T | G | A | T | C | T | T | T | T | T | T | A | T | G | G | T | T | A | T | G | C | C | G | G | C | G | A | T | G | A | T | A | G | G | T | G | G | A | T | C | T | G | G | T | A | A | T | T | G | G | T | T | T | G | T | T | C | C | G | A | T | T | C | T | G | A | T | A | G | G | T | G | C | G | C | C | T | G | A | C | A | T | G | G | C | A | T | T | T | C | C | A | C | G | A | T | T | A |
| Linum sp ((AJ247604) | A | A | T | G | A | T | C | T | T | T | T | T | T | A | T | G | G | T | T | A | T | G | C | C | G | G | C | G | A | T | G | A | T | A | G | G | T | G | G | A | T | C | T | G | G | T | A | A | T | T | G | G | T | T | T | G | T | T | C | C | G | A | T | T | C | T | G | A | T | A | G | G | T | G | C | A | C | C | T | G | A | C | A | T | G | G | C | A | T | T | T | C | C | A | C | G | A | T | T | A |
| Musa nana (AJ247609) | A | A | T | G | A | T | C | T | T | T | T | T | T | A | T | G | G | T | T | A | T | G | C | C | G | G | C | G | A | T | G | A | T | A | G | G | T | G | G | A | T | C | T | G | G | A | A | A | T | T | G | G | T | T | T | G | T | A | C | C | G | A | T | T | C | T | T | A | T | A | G | G | T | G | C | A | C | C | T | G | A | C | A | T | G | G | C | A | T | T | T | C | C | A | C | G | A | T | T | A |
| Beta vulgaris (X57693) | A | A | T | G | A | T | C | T | T | T | T | T | T | A | T | G | G | T | T | A | T | G | C | C | T | G | C | G | A | T | G | A | T | A | G | G | T | G | G | A | T | T | T | G | G | G | A | A | T | T | G | G | T | T | T | G | T | T | C | C | A | A | T | T | C | T | G | A | T | A | G | G | T | G | C | A | C | C | T | G | A | C | A | T | G | G | C | A | T | T | T | C | C | A | C | G | A | T | T | A |
| Betula papyrifera (U77620) | A | A | T | G | A | T | C | T | T | T | T | T | T | A | T | G | G | T | T | A | T | G | C | C | G | G | C | G | A | T | G | A | T | A | G | G | T | G | G | A | T | C | T | G | G | T | A | A | T | T | G | G | T | C | T | G | T | T | C | C | G | A | T | T | C | T | G | A | T | A | G | G | T | G | C | A | C | C | T | G | A | C | A | T | G | G | C | A | T | T | T | C | C | A | C | G | A | T | T | A |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | A | A | T | G | A | T | C | T | T | T | T | T | T | A | T | G | G | T | T | A | T | G | C | C | A | G | C | G | A | T | G | A | T | A | G | G | T | G | G | A | T | C | T | G | G | T | A | A | T | T | G | G | T | C | T | G | T | T | C | C | G | A | T | T | C | T | G | A | T | A | G | G | T | G | C | A | C | C | T | G | A | C | A | T | G | G | C | A | T | T | T | C | C | A | C | G | A | T | T | A |
| Chamaerops humilis (U77621) | A | A | T | G | A | T | C | T | T | T | T | T | T | A | T | G | G | T | T | A | T | G | C | C | G | G | C | G | A | T | G | A | T | A | G | G | T | G | G | A | T | C | T | G | G | T | A | A | T | T | G | G | T | C | T | G | T | T | C | C | G | A | T | T | C | T | G | A | T | A | G | G | T | G | C | A | C | C | T | G | A | C | A | T | G | G | C | A | T | T | T | C | C | A | C | G | A | T | C | A |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | A | A | T | G | A | T | C | T | T | T | T | T | T | A | T | G | G | T | T | A | T | G | C | C | G | G | C | G | A | T | G | A | T | A | G | G | T | G | G | A | T | C | T | G | G | T | A | A | T | T | G | G | T | C | T | G | T | T | C | C | G | A | T | T | C | T | G | A | T | A | G | G | T | G | C | A | C | C | T | G | A | C | A | T | G | G | C | A | T | T | T | C | C | A | C | G | A | T | T | A |
| Magnolia stellata (U77622) | A | A | T | G | A | T | C | T | T | T | T | T | T | A | T | G | G | T | T | A | T | G | C | C | G | G | C | G | A | T | G | A | T | A | G | G | T | G | G | A | T | C | T | G | G | T | A | A | T | T | G | G | T | C | T | G | T | T | C | C | G | A | T | T | C | T | G | A | T | A | G | G | T | G | C | A | C | C | T | G | A | C | A | T | G | G | C | A | T | T | T | C | C | A | C | G | A | T | C | A |
| Pisum sativum (X1440) | C | A | T | G | A | T | C | T | T | T | T | T | T | A | T | G | G | T | T | A | T | G | C | C | G | G | C | G | A | T | G | A | T | A | G | G | T | G | G | A | T | C | T | G | G | T | A | A | T | T | G | G | T | C | T | G | T | T | C | C | G | A | T | T | C | T | T | A | T | A | G | G | T | G | C | A | C | C | T | G | A | C | A | T | G | G | C | A | T | T | T | C | C | A | C | G | A | T | T | A |
| Piper bicolor (AY009448) | A | A | T | G | A | T | C | T | T | T | T | T | T | A | T | G | G | T | T | A | T | G | C | C | G | G | C | G | A | T | G | A | T | A | G | G | T | G | G | A | T | C | T | G | G | T | A | A | T | T | G | G | T | C | T | G | T | T | C | C | G | A | T | T | C | T | G | A | T | A | G | G | T | G | C | A | C | C | T | G | A | C | A | T | G | G | C | A | T | T | T | C | C | A | C | G | A | T | C | A |
| Populus tremuloides (U77623) | A | A | T | G | A | T | C | T | T | T | T | T | T | A | T | G | G | T | T | A | T | G | C | C | G | G | C | G | A | T | G | A | T | A | G | G | T | G | G | A | T | T | T | G | G | T | A | A | T | T | G | G | T | T | T | G | T | T | C | C | G | A | T | T | C | T | G | A | T | A | G | G | T | G | C | A | C | C | T | G | A | C | A | T | G | G | C | A | T | T | T | C | C | A | C | G | A | T | T | A |
| Solanum tuberosum (AF096321) | A | A | T | G | A | T | C | T | T | T | T | T | T | A | T | G | G | T | T | A | T | G | C | C | G | G | C | G | A | T | G | A | T | A | G | G | T | G | G | A | T | C | T | G | G | T | A | A | T | T | G | G | T | C | T | G | T | T | C | C | G | A | T | T | C | T | G | A | T | A | G | G | T | G | C | G | C | C | T | G | A | C | A | T | G | G | C | A | T | T | T | C | C | A | C | G | A | T | T | A |
| Oryza sativa (X15990) | A | A | T | G | A | T | C | T | T | T | T | T | T | A | T | G | G | T | T | A | T | G | C | C | G | G | C | G | A | T | G | A | T | A | G | G | T | G | G | A | T | T | T | G | G | T | A | A | T | T | G | G | T | T | T | G | T | T | C | C | G | A | T | T | C | T | G | A | T | A | G | G | T | G | C | A | C | C | T | G | A | C | A | T | G | G | C | A | T | T | T | C | C | A | C | G | A | T | T | A |
| Sabel palmetto (U77624) | A | A | T | G | A | T | C | T | T | T | T | T | T | A | T | G | G | T | T | A | T | G | C | C | G | G | C | G | A | T | G | A | T | A | G | G | T | G | G | A | T | C | T | G | G | T | A | A | T | T | G | G | T | C | T | G | T | T | C | C | G | A | T | T | C | T | G | A | T | A | G | G | T | G | C | A | C | C | T | G | A | C | A | T | G | G | C | A | T | T | T | C | C | A | C | G | A | T | C | A |
| Glycine max (M16884) | A | A | T | G | A | T | C | T | T | T | T | T | T | A | T | G | G | T | T | A | T | G | C | C | G | G | C | G | A | T | G | A | T | A | G | G | T | G | G | A | T | C | T | G | G | T | A | A | T | T | G | G | T | C | T | G | T | T | C | C | G | A | T | T | C | T | G | A | T | A | G | G | T | G | C | A | C | C | T | G | A | C | A | T | G | G | C | A | T | T | T | C | C | A | C | G | A | T | T | A |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | A | A | T | G | A | T | C | T | T | T | T | T | T | A | T | G | G | T | T | A | T | G | C | C | G | G | C | G | A | T | G | A | T | A | G | G | T | G | G | A | T | T | T | G | G | T | A | A | T | T | G | G | T | C | T | G | T | T | C | C | G | A | T | T | C | T | G | A | T | A | G | G | T | G | C | G | C | C | T | G | A | C | A | T | G | G | C | A | T | T | T | C | C | A | C | G | A | T | T | A |
| Triticum aestivum (Y00417) | A | A | T | G | A | T | C | T | T | T | T | T | T | A | T | G | G | T | T | A | T | G | C | C | G | G | C | G | A | T | G | A | T | A | G | G | T | G | G | A | T | T | T | G | G | T | A | A | T | T | G | G | T | T | T | G | T | T | C | C | G | A | T | T | C | T | G | A | T | A | G | G | T | G | C | A | C | C | T | G | A | C | A | T | G | G | C | A | T | T | T | C | C | A | C | G | A | T | T | A |
| Zea mays (X02660) | A | A | T | G | A | T | C | T | T | T | T | T | T | A | T | G | G | T | T | A | T | G | C | C | G | G | C | G | A | T | G | A | T | A | G | G | T | G | G | A | T | T | T | G | G | G | A | A | T | T | G | G | T | T | T | G | T | T | C | C | G | A | T | T | C | T | G | A | T | A | G | G | T | G | C | A | C | C | T | G | A | C | A | T | G | G | C | A | T | T | T | C | C | A | C | G | A | T | T | A |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sites 301 through 400
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| Peperomia cubensis (AF029783) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Coffea arabica (AJ247586) | A | A | T | A | A | T | A | T | T | T | C | A | T | T | C | T | G | G | T | T | G | T | T | G | C | C | A | C | C | A | A | G | T | C | T | C | T | T | G | C | T | C | T | T | A | T | T | A | A | G | C | T | C | A | G | C | C | T | T | A | G | T | A | G | A | A | G | T | G | G | G | T | A | G | C | G | G | A | A | C | T | G | G | G | T | G | G | A | C | G | G | T | C | T | A | T | C | C | G | C |
| Linum sp ((AJ247604) | A | A | T | A | A | T | A | T | T | T | C | A | T | T | C | T | G | G | T | T | G | T | T | G | C | C | A | C | C | A | A | G | T | C | T | C | T | T | A | C | T | C | C | T | A | T | T | A | A | G | C | T | C | A | G | C | C | T | T | A | G | T | A | G | A | A | G | T | G | G | G | T | A | G | C | G | G | C | A | C | T | G | G | G | T | G | G | A | C | G | G | T | C | T | A | T | C | C | G | C |
| Musa nana (AJ247609) | A | A | T | A | A | T | A | T | A | T | C | A | T | T | C | T | G | G | T | T | G | T | T | G | C | C | A | C | C | A | A | G | T | C | T | C | T | T | G | C | T | C | C | T | A | T | T | A | A | G | C | T | C | A | G | C | C | C | T | A | G | T | A | G | A | A | G | T | G | G | G | T | A | C | C | G | G | C | A | C | T | G | G | G | T | G | G | A | C | G | G | T | C | T | A | T | C | C | G | C |
| Beta vulgaris (X57693) | A | A | T | A | A | T | A | T | T | T | C | A | T | T | C | T | G | G | T | T | G | T | T | G | C | C | C | C | C | A | A | G | T | C | T | C | T | T | G | C | T | C | C | T | A | T | T | A | A | G | C | T | C | A | G | C | C | T | T | G | G | T | A | G | A | A | G | T | G | G | G | T | A | G | C | G | G | G | A | C | T | G | G | G | T | G | G | A | C | G | G | T | C | T | A | T | C | C | G | C |
| Betula papyrifera (U77620) | A | A | T | A | A | T | A | T | T | T | C | A | T | T | C | T | G | G | T | T | G | T | T | G | C | C | A | C | C | A | A | G | T | C | T | C | T | T | G | C | T | C | C | T | A | T | T | A | A | G | C | T | C | A | G | C | C | T | T | A | G | T | A | G | A | A | G | T | G | G | G | T | A | G | C | G | G | C | A | C | T | G | G | G | T | G | G | A | C | G | G | T | C | T | A | T | C | C | G | C |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | A | A | T | A | A | T | A | T | T | T | C | A | T | T | C | T | G | G | T | T | G | T | T | G | C | C | A | C | C | A | A | G | T | C | T | C | T | T | G | C | T | C | C | T | A | T | T | A | A | G | C | T | C | A | G | C | C | T | T | A | G | T | A | G | A | A | G | T | G | G | G | T | A | G | C | G | G | C | A | C | T | G | G | G | T | G | G | A | C | G | G | T | C | T | A | T | C | C | G | C |
| Chamaerops humilis (U77621) | A | A | T | A | A | T | A | T | A | T | C | A | T | T | C | T | G | G | T | T | G | T | T | G | C | C | A | C | C | A | A | G | T | C | T | C | T | T | G | C | T | C | C | T | A | T | T | A | A | G | C | C | C | A | G | C | C | T | T | A | G | T | A | G | A | A | G | T | G | G | G | T | A | C | C | G | G | C | A | C | T | G | G | G | T | G | G | A | C | G | G | T | C | T | A | T | C | C | G | C |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | A | A | T | A | A | T | A | T | T | T | C | A | T | T | C | T | G | G | T | T | G | T | T | G | C | C | A | C | C | A | A | G | T | C | T | C | T | T | G | C | T | C | C | T | A | T | T | A | A | G | C | C | C | A | G | C | C | T | T | A | G | T | A | G | A | A | G | T | G | G | G | T | A | G | C | G | G | C | A | C | T | G | G | G | T | G | G | A | C | G | G | T | C | T | A | T | C | C | G | C |
| Magnolia stellata (U77622) | A | A | T | A | A | T | A | T | T | T | C | A | T | T | C | T | G | G | T | C | G | T | T | G | C | C | A | C | C | A | A | G | T | C | T | C | T | T | G | C | T | C | C | T | A | T | T | A | A | G | C | C | C | A | G | C | C | T | T | A | G | T | A | G | A | A | G | T | G | G | G | T | A | G | C | G | G | C | A | C | T | G | G | G | T | G | G | A | C | G | G | T | C | T | A | T | C | C | G | C |
| Pisum sativum (X1440) | A | A | T | A | A | T | A | T | T | T | C | A | T | T | C | T | G | G | T | T | G | T | T | G | C | C | G | C | C | A | A | G | T | C | T | C | T | T | G | C | T | C | C | T | A | T | T | A | A | G | C | T | C | A | G | C | C | T | T | A | G | T | A | G | A | G | G | T | G | G | G | T | A | G | C | G | G | C | A | C | T | G | G | G | T | G | G | A | C | G | G | T | C | T | A | T | C | C | G | C |
| Piper bicolor (AY009448) | A | A | T | A | A | T | A | T | T | T | C | A | T | T | C | T | G | G | T | T | G | T | T | G | C | C | A | C | C | A | A | G | T | A | T | C | T | T | G | C | T | C | C | T | A | T | T | A | A | G | C | C | C | A | G | C | C | T | T | A | G | T | A | G | A | A | G | T | A | G | G | T | A | G | C | G | G | C | A | C | T | G | G | G | T | G | G | A | C | G | G | T | C | T | A | T | C | C | G | C |
| Populus tremuloides (U77623) | A | A | T | A | A | T | A | T | T | T | C | A | T | T | C | T | G | G | T | T | G | T | T | G | C | C | A | C | C | A | A | G | T | C | T | C | T | T | A | C | T | C | T | T | A | T | T | A | A | G | C | T | C | A | G | C | C | T | T | A | G | T | A | G | A | A | G | T | G | G | G | T | A | G | C | G | G | C | A | C | T | G | G | G | T | G | G | A | C | G | G | T | C | T | A | T | C | C | G | C |
| Solanum tuberosum (AF096321) | A | A | T | A | A | T | A | T | T | T | C | A | T | T | C | T | G | G | T | T | G | T | T | G | C | C | T | C | C | A | A | G | T | C | T | C | T | T | G | C | T | C | C | T | A | T | T | A | A | G | C | T | C | A | G | C | C | T | T | A | G | T | A | G | A | A | G | T | G | G | G | T | A | G | C | G | G | C | A | C | T | G | G | G | T | G | G | A | C | G | G | T | C | T | A | T | C | C | G | C |
| Oryza sativa (X15990) | A | A | T | A | A | T | A | T | A | T | C | A | T | T | C | T | G | G | T | T | G | T | T | G | C | C | A | C | C | A | A | G | T | C | T | C | T | T | G | C | T | C | C | T | A | T | T | A | A | G | C | T | C | A | G | C | C | T | T | A | G | T | A | G | A | A | G | T | G | G | G | C | A | G | C | G | G | C | A | C | T | G | G | G | T | G | G | A | C | G | G | T | C | T | A | T | C | C | G | C |
| Sabel palmetto (U77624) | A | A | T | A | A | T | A | T | A | T | C | A | T | T | C | T | G | G | T | T | G | T | T | G | C | C | A | C | C | A | A | G | T | C | T | C | T | T | G | C | T | C | C | T | A | T | T | A | A | G | C | C | C | A | G | C | C | T | T | A | G | T | A | G | A | A | G | T | A | G | G | T | A | C | C | G | G | C | A | C | T | G | G | G | T | G | G | A | C | G | G | T | C | T | A | T | C | C | G | C |
| Glycine max (M16884) | A | A | T | A | A | T | A | T | T | T | C | A | T | T | C | T | G | G | T | T | G | T | T | G | C | C | G | C | C | A | A | G | T | C | T | C | T | T | G | C | T | C | C | T | A | T | T | A | A | G | C | T | C | A | G | C | C | T | T | A | G | T | A | G | A | A | G | T | G | G | G | T | A | G | C | G | G | C | A | C | T | G | G | G | T | G | G | A | C | G | G | T | C | T | A | T | C | C | G | C |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | A | A | T | A | A | T | A | T | T | T | C | A | T | T | C | T | G | G | T | T | G | T | T | G | C | C | T | C | C | A | A | G | T | C | T | C | T | T | G | C | T | C | C | T | A | T | T | A | A | G | C | T | C | A | G | C | C | T | T | A | G | T | A | G | A | A | G | T | G | G | G | T | A | G | C | G | G | C | A | C | T | G | G | G | T | G | G | A | C | G | G | T | C | T | A | T | C | C | G | C |
| Triticum aestivum (Y00417) | A | A | T | A | A | T | A | T | A | T | C | A | T | T | C | T | G | G | T | T | G | T | T | G | C | C | A | C | C | A | A | G | T | C | T | C | T | T | G | C | T | C | C | T | A | T | T | A | A | G | C | T | C | A | G | C | C | T | T | A | G | T | A | G | A | A | G | T | G | G | G | C | A | G | C | G | G | C | A | C | T | G | G | G | T | G | G | A | C | A | G | T | C | T | A | T | C | C | G | C |
| Zea mays (X02660) | A | A | T | A | A | T | A | T | A | T | C | A | T | T | C | T | G | G | T | T | G | T | T | G | C | C | A | C | C | A | A | G | T | C | T | C | T | T | G | C | T | C | C | T | A | T | T | A | A | G | C | T | C | A | G | C | C | T | T | A | G | T | A | G | A | A | G | T | G | G | G | C | A | G | C | G | G | C | A | C | T | G | G | G | T | G | G | A | C | G | G | T | C | T | A | T | C | C | G | C |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sites 401 through 500
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| Peperomia cubensis (AF029783) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Coffea arabica (AJ247586) | C | C | T | T | A | A | G | T | G | G | T | A | T | T | A | C | C | A | G | C | C | A | T | T | C | T | G | G | A | G | G | A | G | C | A | G | T | T | G | A | T | T | C | A | G | C | A | A | T | T | T | C | T | A | G | T | C | T | T | C | A | T | C | T | A | T | C | T | G | G | T | G | T | T | T | C | A | T | C | C | A | T | T | T | T | A | G | G | T | T | C | T | A | T | C | A | A | T | T | T |
| Linum sp ((AJ247604) | C | C | T | T | A | A | G | T | G | G | T | A | T | T | A | C | C | A | G | C | C | A | T | T | C | T | G | G | A | G | G | A | G | C | A | G | T | T | G | A | T | T | C | A | G | C | A | A | T | T | T | C | T | A | G | T | C | T | T | C | A | T | C | T | A | T | C | T | G | G | T | G | T | T | T | C | A | T | C | C | A | T | T | T | T | A | G | G | T | T | C | T | A | T | C | A | A | T | T | T |
| Musa nana (AJ247609) | C | C | T | T | A | A | G | T | G | G | T | A | T | T | A | C | C | A | G | C | C | A | T | T | C | T | G | G | A | G | G | A | G | C | A | G | T | T | G | A | T | T | C | A | G | C | A | A | T | T | T | C | T | A | G | T | C | T | T | C | A | T | C | T | C | T | C | A | G | G | T | G | T | T | T | C | A | T | C | A | A | T | T | T | T | A | G | G | A | T | C | T | A | T | C | A | A | T | T | T |
| Beta vulgaris (X57693) | C | C | T | T | A | A | G | T | G | G | T | A | T | T | A | C | C | A | G | C | C | A | T | T | C | T | G | G | A | G | G | A | G | C | A | G | T | T | G | A | T | T | T | A | G | C | A | A | T | T | T | T | T | A | G | T | C | T | T | C | A | T | C | T | A | T | C | T | G | G | T | G | T | T | T | C | A | T | C | C | A | T | T | T | T | A | G | G | T | T | C | A | A | T | C | A | A | T | T | T |
| Betula papyrifera (U77620) | C | C | T | T | A | A | G | T | G | G | T | A | T | T | A | C | C | A | G | C | C | A | T | T | C | C | G | G | A | G | G | A | G | C | A | G | T | T | G | A | T | T | C | A | G | C | A | A | T | T | T | C | C | A | G | T | C | T | T | C | A | T | C | T | A | T | C | T | G | G | T | G | T | T | T | C | A | T | C | C | A | T | T | T | T | A | G | G | T | T | C | T | A | T | C | A | A | T | T | T |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | C | C | T | T | A | A | G | T | G | G | T | A | T | T | A | C | C | A | G | C | C | A | T | T | C | T | G | G | A | G | G | A | G | C | A | G | T | T | G | A | T | T | C | A | G | C | A | A | T | T | T | C | T | A | G | T | C | T | T | C | A | T | C | T | A | T | C | T | G | G | T | G | T | T | T | C | A | T | C | C | A | T | T | T | T | A | G | G | T | T | C | T | A | T | A | A | A | T | T | T |
| Chamaerops humilis (U77621) | C | C | T | T | A | A | G | T | G | G | T | A | T | T | A | C | C | A | G | C | C | A | T | T | C | T | G | G | A | G | G | A | G | C | A | G | T | T | G | A | T | T | C | A | G | C | A | A | T | T | T | C | T | A | G | T | C | C | T | C | A | T | C | T | A | T | C | A | G | G | T | G | T | T | T | C | A | T | C | C | A | T | T | T | T | A | G | G | T | T | C | T | A | T | A | A | A | T | T | T |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | C | C | T | T | A | A | G | T | G | G | T | A | T | T | A | C | C | A | G | C | C | A | T | T | C | T | G | G | A | G | G | A | G | C | A | G | T | T | G | A | T | T | C | A | G | C | A | A | T | T | T | C | T | A | G | T | C | T | T | C | A | T | C | T | A | T | C | A | G | G | T | G | T | T | T | C | A | T | C | C | A | T | T | T | T | A | G | G | T | T | C | T | A | T | C | A | A | T | T | T |
| Magnolia stellata (U77622) | C | C | T | T | A | A | G | T | G | G | T | A | T | T | A | C | C | A | G | C | C | A | T | T | C | T | G | G | A | G | G | A | G | C | A | G | T | T | G | A | T | T | C | A | G | C | A | A | T | T | T | C | T | A | G | T | C | C | T | C | A | T | C | T | A | T | C | A | G | G | T | G | T | T | T | C | A | T | C | C | A | T | T | T | T | A | G | G | T | T | C | T | A | T | C | A | A | T | T | T |
| Pisum sativum (X1440) | C | C | T | T | A | A | G | T | G | G | T | A | T | T | A | C | C | A | G | C | C | A | T | T | C | T | G | G | A | G | G | A | G | C | A | G | T | T | G | A | T | T | C | A | G | C | A | A | T | T | T | C | T | A | G | T | C | T | T | C | A | T | C | T | A | T | C | T | G | G | T | G | T | T | T | C | A | T | C | C | A | T | T | T | T | A | G | G | T | T | C | T | A | T | C | A | A | T | T | T |
| Piper bicolor (AY009448) | C | C | T | T | A | A | G | T | G | G | T | A | T | T | A | C | C | A | G | C | C | A | T | T | C | T | G | G | A | G | G | A | G | C | A | G | T | T | G | A | T | T | C | A | G | C | A | A | T | T | T | C | T | A | G | T | C | C | T | C | A | T | C | T | A | T | C | A | G | G | T | G | T | T | T | C | A | T | C | T | A | T | T | T | T | A | G | G | T | T | C | T | A | T | C | A | A | T | T | T |
| Populus tremuloides (U77623) | C | C | T | T | A | A | G | T | G | G | T | A | T | T | A | C | C | A | G | C | C | A | T | T | C | T | G | G | A | G | G | A | G | C | A | G | T | T | G | A | T | T | T | A | G | C | A | A | T | T | T | T | T | A | G | T | C | T | T | C | A | T | C | T | A | T | C | T | G | G | T | G | T | T | T | C | A | T | C | C | A | T | T | T | T | A | G | G | T | T | C | T | A | T | C | A | A | T | T | T |
| Solanum tuberosum (AF096321) | C | C | T | T | A | A | G | T | G | G | T | A | T | T | A | C | C | A | G | C | C | A | T | T | C | T | G | G | A | G | G | A | G | C | A | G | T | T | G | A | T | T | T | A | G | C | A | A | T | T | T | C | T | A | G | T | C | T | T | C | A | T | C | T | A | T | C | T | G | G | T | G | T | T | T | C | A | T | C | C | A | T | T | T | T | A | G | G | T | T | C | T | A | T | T | A | A | T | T | T |
| Oryza sativa (X15990) | C | C | T | T | A | A | G | T | G | G | T | A | T | T | A | C | C | A | G | C | C | A | T | T | C | T | G | G | A | G | G | A | G | C | A | G | T | T | G | A | T | T | T | A | G | C | A | A | T | T | T | T | T | A | G | T | C | T | T | C | A | T | C | T | A | T | C | A | G | G | T | G | T | T | T | C | A | T | C | A | A | T | T | T | T | A | G | G | T | T | C | T | A | T | C | A | A | T | T | T |
| Sabel palmetto (U77624) | C | C | T | T | A | A | G | T | G | G | T | A | T | T | A | C | C | A | G | C | C | A | T | T | C | T | G | G | A | G | G | A | G | C | A | G | T | T | G | A | T | T | C | A | G | C | A | A | T | T | T | C | T | A | G | T | C | C | T | C | A | T | C | T | A | T | C | A | G | G | T | G | T | T | T | C | A | T | C | C | A | T | T | T | T | A | G | G | T | T | C | T | A | T | A | A | A | T | T | T |
| Glycine max (M16884) | C | C | T | T | A | A | G | T | G | G | T | A | T | T | A | C | C | A | G | C | C | A | T | T | C | T | G | G | A | G | G | A | G | C | A | G | T | T | G | A | T | T | C | A | G | C | A | A | T | T | T | C | T | A | G | T | C | T | T | C | A | T | C | T | A | T | C | T | G | G | T | G | T | T | T | C | A | T | C | C | A | T | T | T | T | A | G | G | T | T | C | T | A | T | C | A | A | T | T | T |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | C | C | T | T | A | A | G | T | G | G | T | A | T | T | A | C | C | A | G | C | C | A | T | T | C | T | G | G | A | G | G | A | G | C | A | G | T | T | G | A | T | T | T | A | G | C | A | A | T | T | T | C | T | A | G | T | C | T | T | C | A | T | C | T | A | T | C | T | G | G | T | G | T | T | T | C | A | T | C | C | A | T | T | T | T | A | G | G | T | T | C | T | A | T | T | A | A | T | T | T |
| Triticum aestivum (Y00417) | C | C | T | T | A | A | G | T | G | G | T | A | T | T | A | C | C | A | G | C | C | A | T | T | C | T | G | G | A | G | G | A | G | C | A | G | T | T | G | A | T | T | T | A | G | C | A | A | T | T | T | T | T | A | G | T | C | T | T | C | A | T | C | T | A | T | C | A | G | G | T | A | T | T | T | C | A | T | C | A | A | T | T | T | T | A | G | G | T | T | C | T | A | T | C | A | A | T | T | T |
| Zea mays (X02660) | C | C | T | T | A | A | G | T | G | G | T | A | T | T | A | C | C | A | G | C | C | A | T | T | C | T | G | G | A | G | G | A | G | C | A | G | T | T | G | A | T | T | T | A | G | C | A | A | T | T | T | T | T | A | G | T | C | T | T | C | A | T | C | T | A | T | C | A | G | G | T | G | T | T | T | C | A | T | C | A | A | T | T | T | T | A | G | G | T | T | C | T | A | T | C | A | A | T | T | T |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sites 501 through 600
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| Peperomia cubensis (AF029783) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Coffea arabica (AJ247586) | T | A | T | A | A | C | A | A | C | C | A | T | C | T | T | C | A | A | C | A | T | G | C | G | T | G | G | A | C | C | T | G | G | A | A | T | G | A | C | T | A | T | G | C | A | T | A | G | A | T | C | A | C | C | C | C | T | A | T | T | T | G | T | G | T | G | G | T | C | A | G | T | T | T | T | A | G | T | G | A | C | A | G | C | A | T | T | C | T | C | A | C | T | T | T | T | A | T | T | A |
| Linum sp ((AJ247604) | T | A | T | A | A | C | A | A | C | T | A | T | C | T | T | C | A | A | C | A | T | G | C | G | T | G | G | A | C | C | A | G | G | A | A | T | G | A | C | T | A | T | G | C | A | T | A | G | A | T | C | A | C | C | C | C | T | A | T | T | T | G | T | G | T | G | G | T | C | C | G | T | T | C | T | A | G | T | G | A | C | A | G | C | A | T | T | C | C | C | A | C | T | T | T | T | A | T | T | A |
| Musa nana (AJ247609) | T | A | T | A | A | C | C | A | C | T | A | T | C | T | T | T | A | A | C | A | T | G | C | G | T | G | G | A | C | C | T | G | G | A | A | T | G | A | C | T | A | T | G | C | A | T | A | G | A | T | C | A | C | C | C | C | T | T | T | T | T | G | T | G | T | G | G | T | C | C | G | T | T | C | T | A | G | T | T | A | C | A | G | C | C | T | T | C | C | T | A | C | T | T | T | T | A | T | T | A |
| Beta vulgaris (X57693) | T | A | T | A | A | C | A | A | C | T | A | T | C | T | T | C | A | A | C | A | T | G | C | G | T | G | G | A | C | C | T | G | G | A | A | T | G | A | C | T | A | T | G | C | A | T | A | G | A | T | T | A | C | C | C | T | T | A | T | T | T | G | T | G | T | G | G | T | C | C | G | T | T | C | T | A | G | T | A | A | C | A | G | C | A | T | T | C | C | T | A | C | T | T | T | T | A | T | T | A |
| Betula papyrifera (U77620) | T | A | T | A | A | C | A | A | C | T | A | T | C | T | C | C | A | A | C | A | T | G | C | G | T | G | G | A | C | C | T | G | G | A | A | T | G | A | C | T | A | T | G | C | A | T | A | G | A | T | C | A | C | C | C | C | T | A | T | T | T | G | T | G | T | G | G | T | C | C | G | T | T | C | T | A | G | T | G | A | C | A | G | C | A | T | T | C | C | C | A | C | T | T | T | T | A | T | T | A |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | T | A | T | A | A | C | A | A | C | T | A | T | C | T | C | C | A | A | C | A | T | G | C | G | T | G | G | A | C | C | T | G | G | A | A | T | G | A | C | T | A | T | G | C | A | T | A | G | A | T | C | A | C | C | C | C | T | A | T | T | T | G | T | G | T | G | G | T | C | C | G | T | T | C | T | A | G | T | G | A | C | A | G | C | A | T | T | C | C | C | A | C | T | G | T | T | A | T | T | A |
| Chamaerops humilis (U77621) | T | A | T | A | A | C | A | A | C | T | A | T | C | T | C | C | A | A | C | A | T | G | C | G | T | G | G | A | C | C | T | G | G | A | A | T | G | A | C | T | A | T | G | C | A | T | A | G | A | T | C | A | C | C | C | C | T | T | T | T | T | G | T | G | T | G | G | T | C | C | G | T | T | C | T | A | G | T | G | A | C | A | G | C | A | T | T | C | C | T | A | C | T | T | T | T | A | T | T | A |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | T | A | T | A | A | C | A | A | C | T | A | T | C | T | C | C | A | A | C | A | T | G | C | G | T | G | G | A | C | C | T | G | G | A | A | T | G | A | C | T | A | T | G | C | A | T | A | G | A | T | C | A | C | C | C | C | T | A | T | T | T | G | T | G | T | G | G | T | C | C | G | T | T | C | C | A | G | T | G | A | C | A | G | C | A | T | T | C | C | C | A | C | T | T | T | T | A | T | T | A |
| Magnolia stellata (U77622) | T | A | T | A | A | C | A | A | C | T | A | T | C | T | C | C | A | A | C | A | T | G | C | G | T | G | G | A | C | C | T | G | G | A | A | T | G | A | C | T | A | T | G | C | A | T | A | G | A | T | C | A | C | C | C | C | T | A | T | T | T | G | T | G | T | G | G | T | C | C | G | T | T | C | C | A | G | T | G | A | C | A | G | C | A | T | T | C | C | C | A | C | T | T | T | T | A | T | T | A |
| Pisum sativum (X1440) | T | C | T | A | A | C | A | A | C | T | A | T | C | T | C | C | A | A | C | A | T | G | C | G | T | G | G | A | C | C | T | G | G | A | A | T | G | A | C | T | A | T | G | C | A | T | A | G | A | T | C | A | C | C | C | C | T | A | T | T | T | G | T | G | T | G | G | T | C | C | G | T | T | C | C | A | G | T | A | A | C | A | G | C | A | T | T | C | C | C | A | C | T | T | T | T | A | T | T | A |
| Piper bicolor (AY009448) | T | A | T | A | A | C | C | A | C | T | A | T | C | T | C | C | A | A | C | A | T | G | C | G | T | G | G | A | C | C | T | G | G | A | A | T | G | A | C | T | A | T | G | C | A | T | A | G | A | T | C | A | C | C | C | C | T | A | T | T | T | G | T | G | T | G | G | T | C | C | G | T | T | C | T | A | G | T | G | A | C | A | G | C | A | T | T | C | C | T | A | C | T | T | T | T | A | T | T | A |
| Populus tremuloides (U77623) | T | A | T | A | A | C | A | A | C | T | A | T | C | T | T | C | A | A | C | A | T | G | C | G | T | G | G | A | C | C | T | G | G | A | A | T | G | A | C | T | A | T | G | C | A | T | A | G | A | T | T | A | C | C | C | C | T | A | T | T | T | G | T | G | T | G | G | T | C | C | G | T | T | C | T | A | G | T | G | A | C | A | G | C | A | T | T | C | C | T | A | C | T | T | T | T | A | T | T | A |
| Solanum tuberosum (AF096321) | T | A | T | A | A | C | A | A | C | T | A | T | C | T | T | C | A | A | C | A | T | G | C | G | T | G | G | A | C | C | T | G | G | A | A | T | G | A | C | T | A | T | G | C | A | T | A | G | A | T | C | A | C | C | T | C | T | A | T | T | T | G | T | G | T | G | G | T | C | C | G | T | T | C | T | A | G | T | G | A | C | A | G | C | A | T | T | C | C | C | A | C | T | T | T | T | A | T | T | A |
| Oryza sativa (X15990) | T | A | T | A | A | C | A | A | C | T | A | T | C | T | T | C | A | A | C | A | T | G | C | G | T | G | G | A | C | C | T | G | G | A | A | T | G | A | C | T | A | T | G | C | A | T | A | G | A | T | T | A | C | C | A | C | T | T | T | T | T | G | T | G | T | G | G | T | C | C | G | T | T | C | T | A | G | T | G | A | C | A | G | C | A | T | T | C | C | T | A | C | T | T | T | T | A | T | T | A |
| Sabel palmetto (U77624) | T | A | T | A | A | C | A | A | C | T | A | T | C | T | C | C | A | A | C | A | T | G | C | G | T | G | G | A | C | C | T | G | G | A | A | T | G | A | C | T | A | T | G | C | A | T | A | G | A | T | C | A | C | C | C | C | T | T | T | T | T | G | T | G | T | G | G | T | C | C | G | T | T | C | T | A | G | T | G | A | C | A | G | C | A | T | T | C | C | T | A | C | T | T | T | T | A | T | T | A |
| Glycine max (M16884) | T | A | T | A | A | C | A | A | C | T | A | T | C | T | C | C | A | A | C | A | T | G | C | G | T | G | G | A | C | C | T | G | G | A | A | T | G | A | C | T | A | T | G | C | A | T | A | G | A | T | C | A | C | C | C | C | T | A | T | T | T | G | T | G | T | G | G | T | C | C | G | T | T | C | C | A | G | T | A | A | C | A | G | C | A | T | T | C | C | C | A | C | T | T | T | T | A | T | T | A |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | T | A | T | A | A | C | A | A | C | T | A | T | C | T | T | C | A | A | C | A | T | G | C | G | T | G | G | A | C | C | T | G | G | A | A | T | G | A | C | T | A | T | G | C | A | T | A | G | A | T | C | A | C | C | T | C | T | A | T | T | T | G | T | G | T | G | G | T | C | C | G | T | T | C | T | A | G | T | G | A | C | A | G | C | A | T | T | C | C | C | A | C | T | T | T | T | A | T | T | A |
| Triticum aestivum (Y00417) | T | A | T | A | A | C | A | A | C | T | A | T | C | T | T | C | A | A | C | A | T | G | C | G | T | G | G | A | C | C | T | G | G | A | A | T | G | A | C | T | A | T | G | C | A | T | A | G | A | T | T | A | C | C | A | C | T | T | T | T | T | G | T | G | T | G | G | T | C | C | G | T | T | C | T | A | G | T | G | A | C | A | G | C | A | T | T | C | C | T | A | C | T | T | T | T | A | T | T | A |
| Zea mays (X02660) | T | A | T | A | A | C | T | A | C | T | A | T | C | T | T | C | A | A | C | A | T | G | C | G | T | G | G | A | C | C | T | G | G | A | A | T | G | A | C | T | A | T | G | C | A | T | A | G | A | T | T | A | C | C | A | C | T | T | T | T | T | G | T | G | T | G | G | T | C | C | G | T | T | T | T | A | G | T | G | A | C | A | G | C | A | T | T | C | C | T | A | C | T | T | T | T | A | T | T | A |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | C | G | T | G | G | A | C | C | T | G | G | A | A | T | G | A | C | T | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sites 601 through 700
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| Peperomia cubensis (AF029783) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | G | G | C | T | A | T | T | A | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | A | A | C | C | G | A | T | C | G | A | A | A | C | T | T | T | A | A | T | A | C | A | A | C | C | T | T | T | T | C | T | G | A | T | C | C | A | G | C | T | G | G | A | G | G | G | G | G | A | G | A | C | C | C | A | A | T | A | T | T | A | T |
| Coffea arabica (AJ247586) | T | C | A | C | T | T | C | C | G | G | T | A | C | T | G | G | C | A | G | G | G | G | C | A | A | T | T | A | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | A | A | C | C | G | A | T | C | G | A | A | A | C | T | T | T | A | A | T | A | C | A | A | C | C | T | T | T | T | C | T | G | A | T | C | C | C | G | C | T | G | G | A | G | G | G | G | G | A | G | A | C | C | C | C | A | T | A | T | T | A | T |
| Linum sp ((AJ247604) | T | C | A | C | T | T | C | C | G | G | T | A | C | T | G | G | C | A | G | G | G | G | C | A | A | T | T | A | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | A | A | C | C | G | A | T | C | G | A | A | A | C | T | T | T | A | A | T | A | C | A | A | C | C | T | T | T | T | C | T | G | A | T | C | C | C | G | C | T | G | G | A | G | G | G | G | G | A | G | A | C | C | C | C | A | T | A | T | T | A | T |
| Musa nana (AJ247609) | T | C | A | C | T | T | C | C | G | G | T | A | C | T | G | G | C | A | G | G | G | G | C | A | A | T | A | A | C | A | A | T | G | T | T | A | T | T | A | A | C | C | G | A | T | C | G | A | A | A | C | T | T | T | A | A | T | A | C | A | A | C | C | T | T | T | T | C | T | G | A | T | C | C | T | G | C | T | G | G | A | G | G | G | G | G | A | G | A | C | C | C | T | A | T | A | T | T | A | T |
| Beta vulgaris (X57693) | T | C | A | C | T | T | C | C | G | G | T | A | C | T | G | G | C | G | G | G | G | G | C | A | A | T | T | A | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | A | A | C | C | G | A | T | C | G | A | A | A | C | T | T | T | A | A | T | A | C | A | A | C | C | T | T | T | T | T | T | G | A | T | C | C | C | G | C | T | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A | C | C | C | C | A | T | A | T | T | A | T |
| Betula papyrifera (U77620) | T | C | A | C | T | T | C | C | G | G | T | A | C | T | G | G | C | A | G | G | G | G | C | A | A | T | T | A | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | A | A | C | C | G | A | T | C | G | A | A | A | C | T | T | T | A | A | T | A | C | A | A | C | C | T | T | T | T | T | T | G | A | T | C | C | C | G | C | T | G | G | A | G | G | T | G | G | A | G | A | C | C | C | C | A | T | A | T | T | A | T |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | T | C | A | C | T | T | C | C | G | G | T | A | C | T | G | G | C | A | G | G | G | G | C | A | A | T | T | A | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | A | A | C | C | G | A | T | C | G | A | A | A | C | T | T | T | A | A | T | A | C | A | A | C | C | T | T | T | T | C | T | G | A | T | C | C | C | G | C | T | G | G | A | G | G | G | G | G | A | G | A | C | C | C | C | A | T | A | T | T | A | T |
| Chamaerops humilis (U77621) | T | C | A | C | T | T | C | C | G | G | T | A | C | T | G | G | C | A | G | G | G | G | C | A | A | T | T | A | C | T | A | T | G | T | T | A | T | T | A | A | C | C | G | A | T | C | G | A | A | A | C | T | T | T | A | A | T | A | C | A | A | C | C | T | T | T | T | C | T | G | A | T | C | C | T | G | C | T | G | G | A | G | G | G | G | G | A | G | A | C | C | C | C | A | T | A | T | T | A | T |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | T | C | A | C | T | T | C | C | G | G | T | A | C | T | G | G | C | A | G | G | G | G | C | A | A | T | T | A | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | A | A | C | C | G | A | T | C | G | A | A | A | C | T | T | T | A | A | T | A | C | A | A | C | C | T | T | T | T | C | T | G | A | T | C | C | C | G | C | T | G | G | A | G | G | G | G | G | A | G | A | C | C | C | C | A | T | A | T | T | A | T |
| Magnolia stellata (U77622) | T | C | A | C | T | T | C | C | G | G | T | A | C | T | G | G | C | A | G | G | G | G | C | A | A | T | T | A | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | A | A | C | C | G | A | T | C | G | A | A | A | C | T | T | T | A | A | T | A | C | A | A | C | C | T | T | T | T | C | T | G | A | T | C | C | C | G | C | T | G | G | A | G | G | G | G | G | A | G | A | C | C | C | C | A | T | A | T | T | A | T |
| Pisum sativum (X1440) | T | C | A | C | T | T | C | C | G | G | T | A | C | T | G | G | C | A | G | G | G | G | C | A | A | T | T | A | C | A | A | T | G | T | T | A | T | T | A | A | C | C | G | A | T | C | G | A | A | A | C | T | T | T | A | A | T | A | C | A | A | C | C | T | T | T | T | C | T | G | A | T | C | C | C | G | C | A | G | G | A | G | G | G | G | G | A | G | A | C | C | C | C | A | T | A | T | T | A | T |
| Piper bicolor (AY009448) | T | C | A | C | T | T | C | C | T | G | T | A | C | T | G | G | C | A | G | G | G | G | C | T | A | T | T | A | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | A | A | C | C | G | A | T | C | G | A | A | A | C | T | T | T | A | A | T | A | C | A | A | C | C | T | T | T | T | C | T | G | A | T | C | C | C | G | C | T | G | G | A | G | G | G | G | G | A | G | A | C | C | C | A | A | T | A | T | T | A | T |
| Populus tremuloides (U77623) | T | C | A | C | T | T | C | C | G | G | T | A | C | T | G | G | C | A | G | G | G | G | C | A | A | T | T | A | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | A | A | C | C | G | A | T | C | G | A | A | A | C | T | T | T | A | A | T | A | C | A | A | C | C | T | T | T | T | T | T | G | A | T | C | C | C | G | C | T | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | A | C | C | C | C | A | T | C | T | T | A | T |
| Solanum tuberosum (AF096321) | T | C | A | C | T | T | C | C | G | G | T | A | C | T | G | G | C | A | G | G | G | G | C | A | A | T | T | A | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | A | A | C | C | G | A | T | C | G | A | A | A | C | T | T | T | A | A | T | A | C | A | A | C | C | T | T | T | T | C | T | G | A | T | C | C | C | G | C | T | G | G | A | G | G | G | G | G | A | G | A | C | C | C | C | A | T | A | T | T | A | T |
| Oryza sativa (X15990) | T | C | A | C | T | T | C | C | G | G | T | A | C | T | G | G | C | A | G | G | G | G | C | A | A | T | T | A | C | A | A | T | G | T | T | A | T | T | A | A | C | C | G | A | T | C | G | A | A | A | C | T | T | T | A | A | T | A | C | A | A | C | C | T | T | T | T | T | T | G | A | T | C | C | T | G | C | A | G | G | A | G | G | G | G | G | A | G | A | C | C | C | A | A | T | A | T | T | A | T |
| Sabel palmetto (U77624) | T | C | A | C | T | T | C | C | G | G | T | A | C | T | G | G | C | A | G | G | G | G | C | A | A | T | T | A | C | T | A | T | G | T | T | A | T | T | A | A | C | C | G | A | T | C | G | A | A | A | C | T | T | T | A | A | T | A | C | A | A | C | C | T | T | T | T | C | T | G | A | T | C | C | T | G | C | T | G | G | A | G | G | G | G | G | A | G | A | C | C | C | C | A | T | A | T | T | A | T |
| Glycine max (M16884) | T | C | A | C | T | T | C | C | G | G | T | A | C | T | G | G | C | A | G | G | G | G | C | A | A | T | A | A | C | A | A | T | G | T | T | A | T | T | A | A | C | C | G | A | T | C | G | A | A | A | C | T | T | T | A | A | T | A | C | A | A | C | C | T | T | T | T | C | T | G | A | T | C | C | C | G | C | A | G | G | A | G | G | G | G | G | A | G | A | C | C | C | C | A | T | C | T | T | A | T |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | T | C | A | C | T | T | C | C | G | G | T | A | C | T | G | G | C | A | G | G | G | G | C | A | A | T | T | A | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | A | A | C | C | G | A | T | C | G | A | A | A | C | T | T | T | A | A | T | A | C | A | A | C | C | T | T | T | T | C | T | G | A | T | C | C | C | G | C | T | G | G | A | G | G | G | G | G | A | G | A | C | C | C | C | A | T | A | T | T | A | T |
| Triticum aestivum (Y00417) | T | C | A | C | T | T | C | C | G | G | T | A | C | T | G | G | C | G | G | G | G | G | C | A | A | T | T | A | C | A | A | T | G | T | T | A | T | T | A | A | C | C | G | A | T | C | G | A | A | A | C | T | T | T | A | A | T | A | C | A | A | C | C | T | T | T | T | T | T | G | A | T | C | C | T | G | C | A | G | G | A | G | G | G | G | G | A | G | A | C | C | C | A | A | T | A | T | T | A | T |
| Zea mays (X02660) | T | C | A | C | T | T | C | C | G | G | T | A | C | T | G | G | C | A | G | G | G | G | C | A | A | T | T | A | C | A | A | T | G | T | T | A | T | T | A | A | C | C | G | A | T | C | G | A | A | A | C | T | T | T | A | A | T | A | C | A | A | C | C | T | T | T | T | T | T | G | A | T | C | C | A | G | C | A | G | G | A | G | G | G | G | G | A | G | A | C | C | C | A | A | T | A | T | T | A | T |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | C | T | A | G | C | T | T | T | G | A | A | A | T | T | A | T | G | T | T | G | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sites 701 through 800
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| Peperomia cubensis (AF029783) | A | C | C | A | G | C | A | T | C | T | C | T | T | T | T | G | G | T | T | C | T | T | C | G | G | T | T | T | G | A | A | A | T | G | G | C | C | C | T | T | T | T | C | T | G | A | T | T | C | A | A | A | T | C | T | G | A | A | T | A | C | G | C | A | T | T | G | T | G | C | T | A | T | A | C | G | C | T | G | G | G | A | C | T | G | T | C | T | G | C | T | T | A | A | T | G | G | T | A | C |
| Coffea arabica (AJ247586) | A | C | C | A | G | C | A | T | C | T | C | T | T | T | C | G | G | T | T | C | T | T | C | G | G | T | T | T | T | A | A | A | T | G | G | C | C | C | T | T | T | T | C | A | G | A | T | T | C | A | A | A | T | C | T | G | A | A | T | A | C | G | C | A | T | T | G | C | G | C | T | A | T | A | T | G | C | T | G | G | G | A | C | T | G | T | C | T | G | C | T | T | A | A | T | G | G | T | A | C |
| Linum sp ((AJ247604) | A | C | C | A | G | C | A | T | C | T | C | T | T | T | T | G | G | T | T | C | T | T | C | G | G | T | T | T | T | A | A | A | T | G | G | C | C | C | T | T | T | T | C | A | G | A | T | T | C | A | A | A | T | C | T | G | A | A | T | A | C | G | C | A | T | T | G | C | G | C | T | G | T | A | T | G | C | T | G | G | G | A | C | T | G | T | C | T | G | C | T | T | A | A | T | G | G | T | A | C |
| Musa nana (AJ247609) | A | C | C | A | G | C | A | T | C | T | C | T | T | T | C | G | G | T | T | C | T | T | C | G | G | T | T | T | T | C | A | A | A | G | G | C | C | C | T | T | T | T | C | T | G | A | T | T | C | C | A | A | T | C | G | G | A | A | T | A | C | G | C | A | T | T | G | C | G | C | T | A | T | A | T | G | C | T | G | G | G | A | C | T | G | T | C | T | G | C | T | T | A | A | T | G | G | T | A | C |
| Beta vulgaris (X57693) | A | T | C | A | G | C | A | T | C | T | T | T | T | T | T | G | G | T | T | T | T | T | C | G | G | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Betula papyrifera (U77620) | A | C | C | A | G | C | A | T | C | T | C | T | T | T | C | G | G | T | T | C | T | T | C | G | G | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | A | C | C | A | G | C | A | T | C | T | C | T | T | T | C | G | G | T | T | C | T | T | C | G | G | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Chamaerops humilis (U77621) | A | C | C | A | G | C | A | T | C | T | C | T | T | T | C | G | G | T | T | C | T | T | C | G | G | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | A | C | C | A | G | C | A | T | C | T | C | T | T | T | C | G | G | T | T | C | T | T | C | G | G | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Magnolia stellata (U77622) | A | C | C | A | G | C | A | T | C | T | C | T | T | T | C | G | G | T | T | C | T | T | C | G | G | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Pisum sativum (X1440) | A | C | C | A | G | C | A | T | C | T | C | T | T | T | C | G | G | T | T | C | T | T | C | G | G | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Piper bicolor (AY009448) | A | C | C | A | G | C | A | T | C | T | C | T | T | T | T | G | G | T | T | C | T | T | C | G | G | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Populus tremuloides (U77623) | A | C | C | A | G | C | A | T | C | T | C | T | T | T | T | G | G | T | T | C | T | T | C | G | G | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Solanum tuberosum (AF096321) | A | C | C | A | G | C | A | T | C | T | C | T | T | T | T | G | G | T | T | C | T | T | C | G | G | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Oryza sativa (X15990) | A | C | C | A | G | C | A | T | C | T | C | T | T | T | T | G | G | T | T | C | T | T | C | G | G | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Sabel palmetto (U77624) | A | C | C | A | G | C | A | T | C | T | C | T | T | T | C | G | G | T | T | C | T | T | C | G | G | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Glycine max (M16884) | A | C | C | A | G | C | A | T | C | T | C | T | T | T | C | G | G | T | T | C | T | T | C | G | G | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | A | C | C | A | G | C | A | T | C | T | C | T | T | T | T | G | G | T | T | C | T | T | C | G | G | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Triticum aestivum (Y00417) | A | C | C | A | G | C | A | T | C | T | C | T | T | T | T | G | G | T | T | C | T | T | C | G | G | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Zea mays (X02660) | A | C | C | A | G | C | A | T | C | T | C | T | T | T | T | G | G | T | T | C | T | T | C | G | G | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sites 801 through 900
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| Peperomia cubensis (AF029783) | T | C | C | T | A | C | T | A | T | G | T | T | A | A | T | A | A | G | T | G | G | T | T | T | T | C | T | A | G | T | C | A | A | A | C | C | C | C | G | A | T | C | T | A | G | T | A | A | A | A | A | T | G | G | A | G | T | A | T | C | T | A | A | G | A | C | A | C | A | A | T | C | A | G | C | A | G | G | T | A | A | C | C | A | A | C | G | A | C | A | T | A | A | A | A | G | C | A | G | T |
| Coffea arabica (AJ247586) | T | C | C | T | A | C | T | A | T | G | T | T | C | A | T | A | A | G | T | G | G | T | T | T | T | T | T | A | - | - | - | - | - | - | C | C | C | C | G | A | T | C | T | A | G | T | A | A | A | A | A | T | G | G | G | G | T | A | T | C | T | A | A | G | A | C | A | C | A | A | T | C | A | G | C | A | G | G | T | A | A | C | C | A | A | C | G | A | C | A | T | A | A | A | A | G | C | A | G | T |
| Linum sp ((AJ247604) | T | C | C | T | A | C | T | A | T | G | T | T | C | A | T | A | A | G | T | G | G | T | T | T | T | C | T | A | G | T | A | A | A | A | C | C | C | C | G | A | T | C | T | A | G | T | A | A | A | A | A | T | G | G | A | G | T | A | T | C | T | A | A | G | A | C | A | C | A | A | T | C | A | G | C | A | G | G | T | A | A | C | C | A | A | C | G | A | C | A | T | A | A | A | A | G | C | A | G | T |
| Musa nana (AJ247609) | T | C | C | T | A | C | T | A | T | G | T | T | C | A | T | A | A | G | T | G | G | T | T | T | T | C | T | A | G | T | C | A | A | A | C | C | C | C | G | A | T | C | T | A | G | T | C | A | A | A | A | T | G | G | A | G | T | A | T | C | T | A | A | G | A | C | A | C | A | A | T | C | A | G | C | A | G | G | T | A | A | C | C | A | A | C | G | A | C | A | T | A | A | A | A | G | C | A | G | T |
| Beta vulgaris (X57693) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Betula papyrifera (U77620) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Chamaerops humilis (U77621) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Magnolia stellata (U77622) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Pisum sativum (X1440) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Piper bicolor (AY009448) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Populus tremuloides (U77623) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Solanum tuberosum (AF096321) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Oryza sativa (X15990) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Sabel palmetto (U77624) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Glycine max (M16884) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Triticum aestivum (Y00417) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Zea mays (X02660) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sites 901 through 1000
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| Peperomia cubensis (AF029783) | C | T | A | G | T | A | G | G | A | A | C | C | T | C | A | G | A | G | A | C | T | C | C | A | T | G | C | A | C | A | A | C | A | A | C | T | T | A | T | C | C | A | A | A | A | T | C | C | T | T | C | T | G | T | G | A | G | T | G | G | C | T | A | G | C | A | G | G | A | A | T | T | A | T | C | G | A | T | G | G | T | G | A | T | G | G | A | A | G | T | C | T | T | C | A | A | G | T | T | A |
| Coffea arabica (AJ247586) | C | T | A | G | T | A | G | G | A | A | C | C | T | C | A | G | A | G | A | C | T | A | C | A | C | G | C | G | C | A | A | C | A | A | C | T | T | A | T | C | C | T | A | A | A | T | C | C | T | T | C | T | G | T | G | A | A | T | G | G | C | T | A | G | C | T | G | G | A | A | T | T | A | T | C | G | A | T | G | G | T | G | A | T | G | G | A | A | G | T | A | T | T | C | A | A | G | T | T | A |
| Linum sp ((AJ247604) | C | T | A | G | T | A | G | G | A | A | C | C | T | C | A | G | A | G | A | C | T | A | C | A | T | G | C | G | C | A | A | C | A | A | C | T | T | A | T | C | C | G | T | C | A | T | C | C | T | T | C | T | G | T | G | A | G | T | G | G | C | T | A | G | C | T | G | G | A | A | T | T | A | T | C | G | A | T | G | G | T | G | A | T | G | G | A | A | G | T | A | T | T | C | A | A | G | T | T | A |
| Musa nana (AJ247609) | C | T | A | G | T | A | G | G | A | A | C | C | T | C | A | G | A | G | A | C | T | A | C | A | T | G | C | G | C | A | A | C | A | A | C | T | T | A | T | C | C | T | A | A | A | T | C | C | T | T | C | T | G | T | G | A | G | T | G | G | C | T | A | G | C | A | G | G | A | A | T | T | C | T | C | G | A | T | G | G | T | G | C | T | G | G | A | A | G | T | A | T | T | C | A | A | G | T | T | A |
| Beta vulgaris (X57693) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Betula papyrifera (U77620) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Chamaerops humilis (U77621) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Magnolia stellata (U77622) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Pisum sativum (X1440) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Piper bicolor (AY009448) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Populus tremuloides (U77623) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Solanum tuberosum (AF096321) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Oryza sativa (X15990) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Sabel palmetto (U77624) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Glycine max (M16884) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Triticum aestivum (Y00417) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Zea mays (X02660) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sites 1001 through 1100
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| Peperomia cubensis (AF029783) | G | T | A | A | C | A | A | A | G | G | A | T | A | T | A | C | T | T | T | T | C | T | G | G | A | A | A | T | G | A | C | T | A | T | G | G | G | C | C | T | C | G | A | A | G | A | G | C | T | A | C | G | A | C | T | A | C | T | A | C | G | A | T | A | T | A | T | C | C | A | A | C | A | A | C | A | A | T | T | G | G | A | G | T | G | T | G | G | A | A | G | T | A | T | T | A | A | A | - | A |
| Coffea arabica (AJ247586) | G | T | A | A | A | A | A | A | G | G | A | T | A | C | A | C | T | T | C | T | C | T | T | G | A | A | A | T | T | A | C | T | A | T | G | G | G | A | C | T | T | G | A | A | G | A | T | C | T | A | C | C | A | C | T | A | C | T | A | C | G | A | T | A | T | A | T | C | C | A | A | C | A | T | A | C | G | C | T | T | G | - | - | - | G | T | G | G | A | A | G | T | A | T | T | A | A | A | - | A |
| Linum sp ((AJ247604) | G | T | A | A | A | C | A | A | G | G | A | T | A | T | A | C | T | T | C | T | C | T | T | G | A | A | A | T | T | A | C | T | A | T | G | G | G | A | C | T | T | G | A | A | G | A | T | C | T | A | A | G | A | C | T | A | C | T | A | C | G | A | T | A | T | A | T | C | C | A | A | C | A | T | A | T | G | C | T | T | G | - | - | - | G | T | G | G | A | A | G | T | A | T | T | A | A | A | - | A |
| Musa nana (AJ247609) | G | T | A | A | A | C | A | A | G | G | A | T | C | T | A | C | T | T | C | T | C | T | G | G | A | A | A | T | T | A | C | T | A | T | G | G | G | A | C | T | T | G | C | A | G | A | T | C | T | A | C | G | A | C | T | A | C | T | A | C | G | A | T | A | T | A | T | C | C | A | A | C | A | T | A | T | G | C | T | T | G | - | - | - | G | T | G | G | A | A | G | T | A | T | C | A | A | A | - | A |
| Beta vulgaris (X57693) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Betula papyrifera (U77620) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Chamaerops humilis (U77621) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Magnolia stellata (U77622) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Pisum sativum (X1440) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Piper bicolor (AY009448) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Populus tremuloides (U77623) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Solanum tuberosum (AF096321) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Oryza sativa (X15990) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Sabel palmetto (U77624) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Glycine max (M16884) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Triticum aestivum (Y00417) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Zea mays (X02660) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sites 1101 through 1200
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| Peperomia cubensis (AF029783) | T | G | C | G | A | T | - | C | A | G | G | T | G | C | T | A | A | A | G | C | T | T | A | T | C | G | T | T | A | T | C | G | A | C | T | A | C | A | T | A | A | T | A | A | A | C | T | T | G | G | T | A | T | G | A | T | G | A | A | A | C | T | A | A | T | T | A | A | T | T | G | T | A | T | T | A | A | T | G | G | - | T | A | A | T | A | T | T | C | G | A | C | A | T | T | C | A | G | C | A |
| Coffea arabica (AJ247586) | T | G | C | G | A | G | - | C | A | G | G | T | G | C | T | A | A | A | G | C | T | T | A | T | C | G | T | T | A | T | C | G | A | C | T | A | C | A | T | A | A | T | C | A | C | C | T | T | G | G | T | A | T | G | A | T | T | A | A | A | C | T | A | A | T | G | A | A | T | T | G | T | A | T | A | A | A | T | G | G | - | T | C | A | T | A | T | T | C | G | A | C | A | T | T | C | A | A | C | A |
| Linum sp ((AJ247604) | T | G | C | G | A | T | - | C | A | G | G | T | G | C | T | A | A | A | G | C | T | T | A | T | C | G | T | T | A | T | C | G | A | C | T | A | C | A | T | A | A | T | C | A | A | C | T | T | G | G | T | A | T | G | A | T | T | A | A | A | C | T | C | A | T | G | A | A | T | T | G | T | A | T | T | A | A | T | G | G | - | T | C | A | T | A | T | T | C | G | A | C | A | T | T | C | A | G | C | A |
| Musa nana (AJ247609) | T | T | C | G | A | G | - | C | A | G | G | T | G | C | T | A | A | A | G | C | T | T | A | T | C | G | T | T | A | T | C | G | A | C | T | A | C | A | T | A | A | T | C | A | A | C | T | T | G | G | T | A | T | G | A | T | T | C | A | A | C | T | A | A | T | C | A | A | T | A | G | T | C | T | T | A | A | T | G | G | - | T | A | A | T | A | T | T | C | G | A | C | A | T | T | C | A | G | C | A |
| Beta vulgaris (X57693) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Betula papyrifera (U77620) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Chamaerops humilis (U77621) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Magnolia stellata (U77622) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Pisum sativum (X1440) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Piper bicolor (AY009448) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Populus tremuloides (U77623) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Solanum tuberosum (AF096321) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Oryza sativa (X15990) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Sabel palmetto (U77624) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Glycine max (M16884) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Triticum aestivum (Y00417) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Zea mays (X02660) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sites 1201 through 1300
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| Peperomia cubensis (AF029783) | C | G | A | C | T | A | C | T | T | C | A | A | C | T | A | C | A | T | C | G | T | G | T | C | C | G | C | C | A | A | G | T | A | C | T | G | G | A | T | A | A | C | C | C | T | T | T | A | A | T | T | C | T | A | C | C | T | A | A | T | A | C | A | C | T | T | T | C | A | G | C | T | C | A | A | T | C | C | A | A | T | T | G | G | T | T | T | G | C | T | G | G | A | T | T | C | T | T | T | G |
| Coffea arabica (AJ247586) | C | G | A | C | T | A | C | T | T | C | A | A | C | T | A | C | A | T | C | G | T | G | T | C | T | G | T | C | A | A | G | T | A | C | T | G | G | G | A | A | T | C | C | C | C | G | T | A | A | T | T | C | T | A | C | C | T | A | T | T | C | C | A | C | T | T | G | A | T | G | C | T | C | A | A | T | C | A | A | A | T | T | G | G | T | T | T | G | C | A | G | G | A | T | T | C | T | T | T | G |
| Linum sp ((AJ247604) | C | G | A | C | T | A | C | T | T | C | A | A | C | T | A | C | A | T | C | G | T | G | T | C | T | G | T | C | A | A | G | T | A | C | T | G | G | A | T | A | T | C | C | C | T | G | T | A | A | T | T | C | T | A | C | C | T | A | T | T | A | C | A | C | T | A | G | A | T | G | C | T | C | A | A | T | C | A | A | A | T | T | G | G | T | T | T | G | C | A | G | G | A | T | T | C | T | T | T | G |
| Musa nana (AJ247609) | C | G | A | C | T | A | C | T | T | C | A | A | C | T | A | C | A | T | C | G | T | G | T | C | T | G | T | C | A | A | G | T | A | C | T | T | G | A | T | A | T | C | C | C | T | T | T | A | A | T | T | C | T | A | C | C | T | A | T | T | A | C | A | C | T | A | G | A | T | G | C | T | C | A | A | T | C | C | A | A | T | T | G | G | T | T | T | G | C | A | G | G | A | T | T | C | T | T | T | G |
| Beta vulgaris (X57693) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Betula papyrifera (U77620) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Chamaerops humilis (U77621) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Magnolia stellata (U77622) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Pisum sativum (X1440) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Piper bicolor (AY009448) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Populus tremuloides (U77623) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Solanum tuberosum (AF096321) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Oryza sativa (X15990) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Sabel palmetto (U77624) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Glycine max (M16884) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Triticum aestivum (Y00417) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Zea mays (X02660) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sites 1301 through 1400
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| Peperomia cubensis (AF029783) | A | T | G | C | T | G | A | G | G | G | T | A | C | T | A | T | T | G | G | T | A | T | C | G | C | T | A | T | G | A | A | G | C | A | T | C | G | A | C | T | A | C | C | T | C | A | A | C | T | A | A | G | T | A | T | T | C | G | A | G | T | A | A | A | T | A | A | T | C | A | A | C | T | T | C | T | A | C | A | A | G | A | T | G | T | A | G | A | G | T | C | T | T | T | T | A | G | G | G | T |
| Coffea arabica (AJ247586) | A | T | G | C | T | G | A | T | G | G | T | A | C | T | C | T | T | A | G | T | A | T | A | G | C | T | A | T | G | A | A | G | C | A | T | G | G | A | C | T | A | C | C | T | C | A | A | C | T | A | A | G | T | A | T | T | C | G | A | G | T | A | A | C | T | A | A | T | A | A | A | C | T | T | C | T | A | C | A | A | G | A | T | G | T | A | G | A | G | T | C | T | T | A | T | A | A | G | G | T |
| Linum sp ((AJ247604) | A | T | G | C | T | G | A | C | G | G | T | A | C | C | A | T | T | G | G | T | A | T | C | G | C | T | A | T | G | A | A | G | A | A | T | C | G | A | C | T | A | C | C | T | C | A | A | T | T | A | A | G | T | A | T | T | C | G | A | G | T | A | A | C | T | A | A | T | A | A | A | C | T | T | C | T | A | C | A | A | G | A | T | G | T | A | G | A | G | T | C | T | T | A | T | A | A | G | G | T |
| Musa nana (AJ247609) | A | T | G | C | T | G | A | T | G | G | T | A | C | C | A | T | T | G | G | T | C | T | C | G | C | T | A | T | G | A | A | G | C | A | T | C | G | A | C | T | A | C | C | T | C | A | A | C | T | A | A | G | T | A | T | T | C | G | A | G | T | C | A | A | T | A | A | T | A | A | A | C | T | T | C | T | A | C | A | A | G | A | T | T | G | T | G | A | G | T | C | T | T | A | T | A | A | G | G | T |
| Beta vulgaris (X57693) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Betula papyrifera (U77620) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Chamaerops humilis (U77621) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Magnolia stellata (U77622) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Pisum sativum (X1440) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Piper bicolor (AY009448) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Populus tremuloides (U77623) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Solanum tuberosum (AF096321) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Oryza sativa (X15990) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Sabel palmetto (U77624) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Glycine max (M16884) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Triticum aestivum (Y00417) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Zea mays (X02660) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sites 1401 through 1500
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| Peperomia cubensis (AF029783) | C | G | T | T | T | T | C | G | G | T | G | G | T | A | A | T | A | T | C | T | A | C | T | T | T | T | C | T | A | G | T | A | G | T | C | A | A | A | A | T | G | G | T | T | A | C | T | A | T | C | A | A | T | G | G | T | C | T | G | T | A | C | A | A | A | G | T | C | G | A | A | A | A | G | A | T | G | T | T | A | T | C | A | T | G | A | T | G | C | G | T | C | A | T | T | A | C | T | T | T |
| Coffea arabica (AJ247586) | A | A | T | A | T | T | T | G | G | A | G | G | A | A | G | T | C | T | C | T | A | C | T | T | T | G | A | T | A | G | T | A | G | T | C | A | A | A | A | T | G | G | T | T | A | C | T | A | T | C | A | A | T | G | G | T | C | T | G | T | A | C | A | A | A | G | T | C | G | A | A | A | A | G | A | T | G | T | T | A | T | C | A | T | G | A | T | G | C | T | A | G | A | T | T | A | C | T | T | T |
| Linum sp ((AJ247604) | A | G | T | A | T | T | T | G | G | A | G | G | A | A | A | T | A | T | C | T | A | C | T | T | T | G | A | T | A | G | T | A | G | T | C | A | A | A | A | T | G | G | T | T | A | C | T | A | T | C | A | A | T | G | G | T | C | T | G | T | A | C | A | A | A | G | T | A | G | A | A | A | A | G | A | T | G | T | A | A | T | C | A | T | G | A | T | G | C | T | A | G | A | T | T | A | C | T | T | T |
| Musa nana (AJ247609) | C | G | T | A | T | T | T | G | G | A | G | G | A | A | A | T | A | T | C | T | A | C | T | T | T | G | A | T | A | G | T | A | G | T | C | A | A | A | A | T | G | G | T | C | A | C | T | A | T | C | A | A | T | G | G | T | C | T | G | T | A | C | A | A | A | G | T | C | G | A | A | A | A | G | A | T | G | T | T | A | T | C | A | T | G | A | T | G | C | T | A | G | A | T | T | A | C | T | T | T |
| Beta vulgaris (X57693) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Betula papyrifera (U77620) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Chamaerops humilis (U77621) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Magnolia stellata (U77622) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Pisum sativum (X1440) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Piper bicolor (AY009448) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Populus tremuloides (U77623) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Solanum tuberosum (AF096321) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Oryza sativa (X15990) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Sabel palmetto (U77624) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Glycine max (M16884) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Triticum aestivum (Y00417) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Zea mays (X02660) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sites 1501 through 1600
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| Peperomia cubensis (AF029783) | A | A | A | T | C | A | A | G | T | A | C | T | T | T | C | C | G | A | A | G | T | C | A | T | A | A | A | T | C | A | C | G | A | C | G | A | T | T | C | T | T | C | C | T | T | A | T | T | T | C | G | G | A | A | T | A | T | T | A | C | A | G | T | C | T | T | T | A | C | G | A | T | C | T | C | A | A | A | G | C | A | T | T | T | C | A | A | C | C | T | T | C | C | A | G | T | A | T | G | A |
| Coffea arabica (AJ247586) | A | A | A | T | C | A | A | A | T | A | C | T | T | T | C | C | G | A | A | G | T | C | A | T | A | A | A | T | C | A | C | G | A | C | G | A | T | T | C | T | T | C | C | T | T | A | T | T | G | A | G | G | A | A | T | A | T | T | A | C | A | G | T | C | T | T | T | A | C | G | A | T | C | T | C | A | A | A | G | C | A | T | T | T | A | A | A | C | C | T | G | A | C | A | G | T | C | T | T | C |
| Linum sp ((AJ247604) | A | A | A | T | C | A | A | G | T | A | C | T | T | T | C | C | G | A | A | G | T | C | A | T | A | A | A | T | C | A | C | G | A | C | G | A | T | T | C | T | T | C | C | T | T | A | T | T | G | A | G | G | A | A | T | A | T | T | A | C | A | G | T | C | T | T | T | A | C | G | A | T | C | T | C | A | A | A | G | C | A | T | T | T | A | A | A | C | C | T | G | A | C | A | G | T | A | T | T | C |
| Musa nana (AJ247609) | A | A | A | T | C | A | A | G | T | G | C | T | T | T | C | C | G | A | A | G | T | A | A | T | A | A | A | T | C | A | C | T | A | C | G | A | T | T | C | T | T | C | C | T | T | A | T | T | G | A | G | G | A | A | T | A | T | T | A | C | A | G | T | C | T | T | T | A | C | G | A | T | C | T | C | A | A | A | G | C | A | T | T | T | C | A | A | C | C | T | G | A | C | A | G | T | A | T | T | C |
| Beta vulgaris (X57693) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Betula papyrifera (U77620) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Chamaerops humilis (U77621) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Magnolia stellata (U77622) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Pisum sativum (X1440) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Piper bicolor (AY009448) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Populus tremuloides (U77623) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Solanum tuberosum (AF096321) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Oryza sativa (X15990) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Sabel palmetto (U77624) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Glycine max (M16884) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Triticum aestivum (Y00417) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Zea mays (X02660) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sites 1601 through 1700
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| Peperomia cubensis (AF029783) | A | C | C | A | T | A | A | A | G | C | A | T | G | G | C | T | A | G | C | T | T | T | C | C | T | A | G | A | C | A | A | A | T | G | G | A | A | T | A | A | G | T | T | G | A | T | G | A | T | A | T | A | G | T | C | C | A | C | C | T | T | T | C | T | T | C | T | A | T | T | C | A | T | C | C | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Coffea arabica (AJ247586) | A | C | C | A | T | A | A | A | G | T | A | T | G | G | C | T | A | G | C | T | T | T | C | C | T | A | G | A | T | A | A | A | T | G | G | A | A | T | A | A | G | T | T | G | A | T | G | A | T | A | T | A | G | T | C | C | A | C | C | T | T | T | C | T | T | C | T | A | T | T | C | A | T | C | C | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Linum sp ((AJ247604) | A | C | C | A | T | A | A | A | G | C | A | T | G | G | C | T | A | G | C | T | T | T | C | C | T | A | G | A | A | A | A | A | T | G | G | A | A | T | A | A | G | T | T | G | A | T | G | A | T | A | T | A | G | T | C | C | A | C | C | T | T | T | C | T | T | C | T | A | T | T | C | A | T | C | C | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Musa nana (AJ247609) | A | C | C | A | T | A | A | A | G | C | A | T | G | G | C | T | A | G | C | T | T | T | C | C | T | A | G | A | C | A | A | A | T | G | G | A | A | T | A | A | G | T | T | G | A | T | G | A | T | A | T | A | G | T | C | C | A | C | C | T | T | T | C | T | T | C | T | A | T | T | C | A | T | C | C | G | C | G | A | T | G | A | T | A | T | A | G | T | C | T | A | C | C | T | T | T | C | T | T | C |
| Beta vulgaris (X57693) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Betula papyrifera (U77620) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Chamaerops humilis (U77621) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Magnolia stellata (U77622) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Pisum sativum (X1440) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Piper bicolor (AY009448) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Populus tremuloides (U77623) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Solanum tuberosum (AF096321) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Oryza sativa (X15990) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Sabel palmetto (U77624) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Glycine max (M16884) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Triticum aestivum (Y00417) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Zea mays (X02660) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sites 1701 through 1800
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| Peperomia cubensis (AF029783) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | T | A | T | A | T | T | A | G | T | A | G | A | A | G | A | G | A | G | A | A | G | C | A | C | C | C | T | G | A | A | G | T | G | T | A | T | A | T | T | C | C | C | A | T | T | C | T | G | C | C | T | G | G | A | T | C | T | G | G | T | A | T | C | A | T | A | A | G | T | C | A | T | A | T | C | G | T | A | T | C | G | A | C | T | T | T | T | T |
| Coffea arabica (AJ247586) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | T | T | A | G | T | A | G | A | A | G | A | G | A | G | A | A | G | C | A | T | C | C | A | G | A | G | G | T | G | T | A | T | A | T | T | C | C | C | A | T | T | C | T | G | C | C | T | G | G | A | T | C | C | G | G | T | A | T | C | A | T | A | A | G | T | C | A | T | A | T | C | G | T | T | T | C | G | A | C | T | T | T | T | T |
| Linum sp ((AJ247604) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | T | A | T | A | T | T | A | G | T | A | G | A | A | G | A | G | A | G | A | A | G | C | A | C | C | C | T | G | A | A | G | T | T | T | A | C | A | T | C | C | T | C | A | T | T | C | T | G | C | C | T | G | G | A | T | T | C | G | G | T | A | T | C | A | T | A | A | G | T | C | A | T | A | T | C | G | T | T | T | C | G | A | C | T | T | T | T | T |
| Musa nana (AJ247609) | T | A | T | T | C | A | T | C | C | G | C | T | T | A | T | A | G | T | A | G | T | A | G | A | A | G | A | G | A | G | A | A | G | C | A | C | C | C | T | G | A | A | G | T | T | T | A | C | A | T | C | C | T | A | A | T | T | C | T | G | C | C | T | G | G | A | T | C | C | G | G | T | A | T | C | A | T | A | A | G | T | C | A | T | A | T | C | G | T | T | T | C | T | A | C | T | T | T | T | T |
| Beta vulgaris (X57693) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | A | T | C | C | A | G | A | G | G | T | C | T | A | T | A | T | T | C | T | C | A | T | T | C | T | G | C | C | T | G | G | A | T | T | C | G | G | T | A | T | C | A | T | A | A | G | T | C | A | T | A | T | C | G | T | T | T | C | T | A | C | T | T | T | T | T |
| Betula papyrifera (U77620) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | A | T | C | C | A | G | A | G | G | T | G | T | A | T | A | T | T | C | C | C | A | T | T | C | T | G | C | C | T | G | G | A | T | C | C | G | G | T | A | T | C | A | T | A | A | G | T | C | A | T | A | T | C | G | T | T | T | C | G | A | C | T | T | T | T | T |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | A | C | C | C | T | G | A | A | G | T | T | T | A | T | A | T | T | C | T | C | A | T | T | C | T | G | C | C | T | G | G | A | T | C | C | G | G | T | A | T | C | A | T | A | A | G | T | C | A | T | A | T | C | G | T | T | T | C | G | A | C | T | T | T | T | T |
| Chamaerops humilis (U77621) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | A | T | C | C | A | G | A | G | G | T | G | T | A | T | A | T | T | C | C | C | A | T | T | C | T | G | C | C | T | G | G | A | T | C | C | G | G | T | A | T | T | A | T | T | A | G | T | C | A | T | A | T | C | G | T | A | T | C | G | A | C | C | T | T | T | T |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | A | T | C | C | A | G | A | G | G | T | G | T | A | T | A | T | T | C | C | C | A | T | T | C | C | G | C | C | T | G | G | A | T | C | C | G | G | T | A | T | C | A | T | A | A | G | T | C | A | T | A | T | C | G | T | A | T | C | G | A | C | T | T | T | T | T |
| Magnolia stellata (U77622) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | A | T | C | C | A | G | A | G | G | T | G | T | A | T | A | T | T | C | C | C | A | T | T | C | T | G | C | C | T | G | G | A | T | C | C | G | G | T | A | T | C | A | T | A | A | G | T | C | A | T | A | T | C | G | T | A | T | C | G | A | C | T | T | T | T | T |
| Pisum sativum (X1440) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | A | T | C | C | A | G | A | G | G | T | G | T | A | T | A | T | T | C | C | A | A | T | T | C | T | G | C | C | T | G | G | A | T | C | C | G | G | T | A | T | C | A | T | A | A | G | T | C | A | T | A | T | C | G | T | T | T | C | G | A | C | T | T | T | T | T |
| Piper bicolor (AY009448) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | A | T | C | C | A | G | A | G | G | T | G | T | A | T | A | T | T | C | C | C | A | T | T | C | C | G | C | C | T | G | G | A | T | C | T | G | G | T | A | T | C | A | T | A | A | G | T | C | A | T | A | T | C | G | T | A | T | C | G | A | C | T | T | T | T | T |
| Populus tremuloides (U77623) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | A | T | C | C | A | G | A | G | G | T | G | T | A | T | A | T | T | C | T | C | A | T | T | C | T | G | C | C | T | G | G | A | T | T | C | G | G | G | A | T | C | A | T | A | A | G | T | C | A | T | A | T | C | G | T | T | T | C | T | A | C | T | T | T | C | T |
| Solanum tuberosum (AF096321) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | A | T | C | C | A | G | A | G | G | T | G | T | A | T | A | T | T | C | C | C | A | T | T | C | T | G | C | C | T | G | G | A | T | C | C | G | G | T | A | T | C | A | T | A | A | G | T | C | A | T | A | T | C | G | T | T | T | C | T | A | C | T | T | T | T | T |
| Oryza sativa (X15990) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | A | T | C | C | A | G | A | G | G | T | G | T | A | T | A | T | T | C | T | C | A | T | T | C | T | G | C | C | T | G | G | A | T | T | C | G | G | T | A | T | T | A | T | T | A | G | T | C | A | T | A | T | C | G | T | A | T | C | G | A | C | C | T | T | T | T |
| Sabel palmetto (U77624) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | A | T | C | C | A | G | A | G | G | T | G | T | A | T | A | T | T | C | C | C | A | T | T | C | T | G | C | C | T | G | G | A | T | C | C | G | G | T | A | T | T | A | T | T | A | G | T | C | A | T | A | T | C | G | T | A | T | C | G | A | C | C | T | T | T | T |
| Glycine max (M16884) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | A | T | C | C | A | G | A | G | G | T | G | T | A | T | A | T | T | C | C | C | A | T | T | C | T | G | C | C | T | G | G | A | T | C | C | G | G | T | A | T | C | A | T | A | A | G | T | C | A | T | A | T | C | G | T | T | T | C | G | A | C | T | T | T | T | T |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | A | T | C | C | A | G | A | G | G | T | G | T | A | T | A | T | T | C | C | C | A | T | T | C | T | G | C | C | T | G | G | A | T | C | C | G | G | T | A | T | C | A | T | A | A | G | T | C | A | T | A | T | C | G | T | T | T | C | T | A | C | T | T | T | T | T |
| Triticum aestivum (Y00417) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | A | T | C | C | A | G | A | G | G | T | G | T | A | T | A | T | T | C | T | C | A | T | T | C | T | G | C | C | T | G | G | A | T | T | T | G | G | T | A | T | T | A | T | T | A | G | T | C | A | T | A | T | C | G | T | A | T | C | G | A | C | C | T | T | T | T |
| Zea mays (X02660) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | A | T | C | C | A | G | A | G | G | T | G | T | A | T | A | T | T | C | T | C | A | T | T | C | T | G | C | C | T | G | G | A | T | T | C | G | G | T | A | T | T | A | T | T | A | G | T | C | A | T | A | T | C | G | T | A | T | C | G | A | C | C | T | T | T | T |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sites 1801 through 1900
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| Peperomia cubensis (AF029783) | C | G | G | G | A | A | A | A | C | C | G | G | T | C | T | T | C | G | G | G | T | A | T | G | A | T | G | G | C | A | T | G | G | T | T | T | A | T | G | C | A | A | T | G | A | T | C | A | G | T | A | T | A | G | G | T | G | T | T | C | T | T | G | G | A | T | T | T | C | T | T | G | T | T | C | G | G | G | C | T | C | A | T | C | A | T | A | T | G | T | T | T | A | C | A | G | T | G | G | G |
| Coffea arabica (AJ247586) | C | A | G | G | A | A | A | A | C | C | G | G | T | C | T | T | C | G | G | G | T | A | T | C | T | A | G | G | C | A | T | G | G | T | T | T | A | T | G | C | C | A | T | G | A | T | C | A | G | T | A | T | A | G | G | T | G | T | T | C | T | T | G | G | A | T | T | T | C | T | T | G | T | T | T | G | G | G | C | T | C | A | T | C | A | T | A | T | G | T | T | T | A | C | T | G | T | G | G | G |
| Linum sp ((AJ247604) | C | G | G | G | A | A | A | A | C | C | T | G | T | T | T | T | C | G | G | G | T | A | T | C | T | A | G | G | C | A | T | G | G | T | T | T | A | T | G | C | C | A | T | G | A | T | C | A | G | T | A | T | A | G | G | T | G | T | T | C | T | T | G | G | A | T | T | T | C | T | T | G | T | T | T | G | G | G | C | T | C | A | T | C | A | T | A | T | G | T | T | T | A | C | T | G | T | G | G | G |
| Musa nana (AJ247609) | C | G | A | A | A | A | A | A | C | C | G | G | T | C | T | T | C | G | G | G | T | A | T | C | T | A | G | G | C | A | T | G | G | T | T | T | A | T | G | C | C | A | T | G | A | T | C | A | G | T | A | T | A | G | G | T | G | T | T | C | T | T | G | G | A | T | T | T | C | T | T | G | T | T | T | G | G | G | C | T | C | A | T | C | A | T | A | T | G | T | T | T | A | C | T | G | T | G | G | G |
| Beta vulgaris (X57693) | C | C | G | G | A | A | A | A | C | C | G | G | T | C | T | T | C | G | G | G | T | A | T | C | T | A | G | G | C | A | T | G | G | T | T | T | A | T | G | C | C | A | T | G | A | T | C | A | G | T | A | T | A | G | G | T | G | T | T | C | T | T | G | G | A | T | T | T | C | T | T | G | T | T | T | G | G | G | C | T | C | A | T | C | A | T | A | T | G | T | T | T | A | C | T | G | T | G | G | G |
| Betula papyrifera (U77620) | C | G | G | G | A | A | A | A | C | C | G | G | T | C | T | T | C | G | G | G | T | A | T | C | T | A | G | G | C | A | T | G | G | T | T | T | A | T | G | C | C | A | T | G | A | T | C | A | G | T | A | T | A | G | G | T | G | T | T | C | T | T | G | G | A | T | T | T | C | T | T | G | T | T | T | G | G | G | C | T | C | A | T | C | A | T | A | T | G | T | T | T | A | C | T | G | T | G | G | G |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | C | G | G | G | G | A | A | A | C | C | G | G | T | T | T | T | T | G | G | G | T | A | T | C | T | A | G | G | C | A | T | G | G | T | T | T | A | T | G | C | C | A | T | G | A | T | C | A | G | T | A | T | A | G | G | T | G | T | T | C | T | T | G | G | A | T | T | T | C | T | T | G | T | T | T | G | G | G | C | T | C | A | T | C | A | T | A | T | G | T | T | T | A | C | T | G | T | G | G | G |
| Chamaerops humilis (U77621) | C | G | G | G | A | A | A | A | C | C | G | G | T | C | T | T | C | G | G | G | T | A | T | T | T | A | G | G | C | A | T | G | G | T | T | T | A | T | G | C | C | A | T | G | A | T | C | A | G | T | A | T | A | G | G | T | G | T | T | C | C | T | G | G | A | T | C | T | C | T | T | G | T | T | C | G | G | G | C | T | C | A | T | C | A | T | A | T | G | T | T | T | A | C | T | G | T | G | G | G |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | C | G | G | G | A | A | A | A | C | C | G | G | T | C | T | T | C | G | G | G | T | A | T | C | T | A | G | G | C | A | T | G | G | T | T | T | A | T | G | C | C | A | T | G | A | T | C | A | G | T | A | T | A | G | G | T | G | T | T | C | C | T | G | G | A | T | C | T | C | T | T | G | T | T | C | G | G | G | C | T | C | A | T | C | A | T | A | T | G | T | T | T | A | C | T | G | T | G | G | G |
| Magnolia stellata (U77622) | C | G | G | G | A | A | A | A | C | C | G | G | T | C | T | T | C | G | G | G | T | A | T | C | T | A | G | G | C | A | T | G | G | T | T | T | A | T | G | C | C | A | T | G | A | T | C | A | G | T | A | C | A | G | G | T | G | T | T | C | C | T | G | G | A | T | C | T | C | T | T | G | T | T | C | G | G | G | C | T | C | A | T | C | A | T | A | T | G | T | T | T | A | C | T | G | T | G | G | G |
| Pisum sativum (X1440) | C | G | G | G | A | A | A | A | C | C | G | G | T | C | T | T | C | G | G | G | T | A | T | C | T | A | G | G | C | A | T | G | G | T | T | T | A | T | G | C | C | A | T | G | A | T | C | A | G | T | A | T | A | G | G | T | G | T | T | C | T | T | G | G | A | T | T | T | C | T | T | G | T | T | T | G | G | G | C | T | C | A | T | C | A | T | A | T | G | T | T | T | A | C | T | G | T | G | G | G |
| Piper bicolor (AY009448) | C | G | G | G | A | A | A | A | C | C | G | G | T | C | T | T | C | G | G | G | T | A | T | C | T | A | G | G | C | A | T | G | G | T | T | T | A | T | G | C | C | A | T | G | A | T | C | A | G | T | A | T | A | G | G | T | G | T | T | C | T | T | G | G | A | T | T | T | C | T | T | G | T | T | C | G | G | G | C | T | C | A | T | C | A | T | A | T | G | T | T | T | A | C | A | G | T | G | G | G |
| Populus tremuloides (U77623) | C | T | G | G | A | A | A | A | C | C | G | G | T | T | T | T | C | G | G | G | T | A | T | C | T | A | G | G | C | A | T | G | G | T | T | T | A | T | G | C | C | A | T | G | A | T | C | A | G | T | A | T | A | G | G | T | G | T | T | C | T | T | G | G | A | T | T | T | C | T | T | G | T | T | T | G | G | G | C | T | C | A | T | C | A | T | A | T | G | T | T | T | A | C | T | G | T | G | G | G |
| Solanum tuberosum (AF096321) | C | G | G | G | A | A | A | A | C | C | G | G | T | T | T | T | C | G | G | G | T | A | T | C | T | A | G | G | C | A | T | G | G | T | T | T | A | T | G | C | C | A | T | G | A | T | C | A | G | T | A | T | A | G | G | T | G | T | T | C | T | T | G | G | A | T | T | T | C | T | T | G | T | T | T | G | G | G | C | T | C | A | T | C | A | T | A | T | G | T | T | T | A | C | T | G | T | G | G | G |
| Oryza sativa (X15990) | C | A | A | G | A | A | A | A | C | C | G | G | T | C | T | T | C | G | G | G | T | A | T | C | T | A | G | G | C | A | T | G | G | T | T | T | A | T | G | C | C | A | T | G | A | T | A | A | G | T | A | T | A | G | G | T | G | T | T | C | T | T | G | G | A | T | T | T | C | T | A | G | T | T | T | G | G | G | C | T | C | A | T | C | A | T | A | T | G | T | T | T | A | C | T | G | T | G | G | G |
| Sabel palmetto (U77624) | C | G | G | G | A | A | A | A | C | C | G | G | T | C | T | T | C | G | G | G | T | A | T | T | T | A | G | G | C | A | T | G | G | T | T | T | A | T | G | C | C | A | T | G | A | T | C | A | G | T | A | T | A | G | G | T | G | T | T | C | C | T | G | G | A | T | C | T | C | T | T | G | T | T | C | G | G | G | C | T | C | A | T | C | A | T | A | T | G | T | T | T | A | C | T | G | T | G | G | G |
| Glycine max (M16884) | C | G | G | G | A | A | A | A | C | C | G | G | T | C | T | T | C | G | G | G | T | A | T | C | T | A | G | G | C | A | T | G | G | T | T | T | A | T | G | C | C | A | T | G | A | T | C | A | G | T | A | T | A | G | G | T | G | T | T | C | T | T | G | G | A | T | T | T | C | T | T | G | T | T | T | G | G | G | C | T | C | A | T | C | A | T | A | T | G | T | T | T | A | C | T | G | T | G | G | G |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | C | G | G | G | A | A | A | A | C | C | G | G | T | T | T | T | C | G | G | G | T | A | T | C | T | A | G | G | C | A | T | G | G | T | T | T | A | T | G | C | C | A | T | G | A | T | C | A | G | T | A | T | A | G | G | T | G | T | T | C | T | T | G | G | A | T | T | T | C | T | T | G | T | T | T | G | G | G | C | T | C | A | T | C | A | T | A | T | G | T | T | T | A | C | T | G | T | G | G | G |
| Triticum aestivum (Y00417) | C | A | A | G | A | A | A | A | C | C | G | G | T | C | T | T | C | G | G | G | T | A | T | C | T | A | G | G | C | A | T | G | G | T | T | T | A | T | G | C | C | A | T | G | A | T | A | A | G | T | A | T | A | G | G | T | G | T | T | C | T | T | G | G | A | T | T | T | C | T | A | G | T | T | T | G | G | G | C | T | C | A | T | C | A | T | A | T | G | T | T | T | A | C | T | G | T | G | G | G |
| Zea mays (X02660) | C | A | A | G | A | A | A | A | C | C | G | G | T | C | T | T | C | G | G | G | T | A | T | C | T | A | G | G | C | A | T | G | G | T | T | T | A | T | G | C | C | A | T | G | A | T | A | A | G | T | A | T | A | G | G | T | G | T | T | C | T | T | G | G | A | T | T | T | C | T | A | G | T | T | T | G | G | G | C | T | C | A | T | C | A | T | A | T | G | T | T | T | A | C | T | G | T | G | G | G |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sites 1901 through 2000
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| Peperomia cubensis (AF029783) | C | T | T | A | G | A | C | G | T | T | G | A | T | A | C | G | C | G | T | G | C | C | T | A | C | T | T | C | A | C | C | G | C | A | G | C | T | A | C | C | A | T | G | A | T | C | A | T | A | G | C | G | G | T | C | C | C | C | A | C | T | G | G | A | A | T | C | A | A | A | A | T | A | T | T | T | A | G | T | T | G | G | A | T | C | G | C | T | A | C | C | A | T | G | T | G | G | G | G | A |
| Coffea arabica (AJ247586) | C | T | T | A | G | A | C | G | T | T | G | A | T | A | C | C | C | G | T | G | C | C | T | A | C | T | T | C | A | C | C | G | C | A | G | C | T | A | C | C | A | T | G | A | T | C | A | T | A | G | C | T | G | T | C | C | C | C | A | C | T | G | G | A | A | T | C | A | A | A | A | T | C | T | T | T | A | G | T | T | G | G | A | T | C | G | C | T | A | C | C | A | T | G | T | G | G | G | G | G |
| Linum sp ((AJ247604) | C | T | T | A | G | A | C | G | T | T | G | A | T | A | C | C | C | G | T | G | C | C | T | A | C | T | T | C | A | C | C | G | C | A | G | C | T | A | C | C | A | T | G | A | T | C | A | T | A | G | C | T | G | T | C | C | C | C | A | C | T | G | G | A | A | T | A | A | A | A | A | T | C | T | T | T | A | G | T | T | G | G | A | T | C | G | C | T | A | C | C | A | T | G | T | G | G | G | G | G |
| Musa nana (AJ247609) | C | T | T | A | G | A | C | G | T | T | G | A | T | A | C | G | C | G | T | G | C | C | T | A | C | T | T | C | A | C | C | G | C | T | G | C | T | A | C | C | A | T | G | A | T | C | A | T | A | G | C | T | G | T | C | C | C | T | A | C | T | G | G | G | A | T | C | A | A | A | A | T | C | T | T | T | A | G | T | T | G | G | A | T | C | G | C | T | A | C | T | A | T | G | T | G | G | G | G | A |
| Beta vulgaris (X57693) | C | T | T | A | G | A | C | G | T | T | G | A | T | A | C | C | C | G | T | G | C | T | T | A | C | T | T | C | A | C | C | G | C | A | G | C | T | A | C | C | A | T | G | A | T | C | A | T | A | G | C | G | G | T | C | C | C | C | A | C | T | G | G | A | A | T | T | A | A | A | A | T | C | T | T | T | A | G | T | T | G | G | A | T | C | G | C | T | A | C | C | A | T | G | T | G | G | G | G | G |
| Betula papyrifera (U77620) | C | T | T | A | G | A | C | G | T | C | G | A | T | A | C | C | C | G | T | G | C | C | T | A | C | T | T | C | A | C | C | G | C | A | G | C | T | A | C | C | A | T | G | A | T | C | A | T | A | G | C | T | G | T | C | C | C | C | A | C | T | G | G | A | A | T | A | A | A | A | A | T | C | T | T | T | A | G | T | T | G | G | A | T | C | G | C | T | A | C | C | A | T | G | T | G | G | G | G | G |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | C | T | T | A | G | A | C | G | T | T | G | A | T | A | C | C | C | G | T | G | C | C | T | A | C | T | T | C | A | C | G | G | C | A | G | C | T | A | C | C | A | T | G | A | T | C | A | T | A | G | C | T | G | T | C | C | C | C | A | C | T | G | G | A | A | T | C | A | A | A | A | T | C | T | T | T | A | G | T | T | G | G | A | T | C | G | C | T | A | C | C | A | T | G | T | G | G | G | G | G |
| Chamaerops humilis (U77621) | C | T | T | A | G | A | C | G | T | T | G | A | T | A | C | G | C | G | T | G | C | C | T | A | C | T | T | C | A | C | C | G | C | A | G | C | T | A | C | C | A | T | G | A | T | C | A | T | A | G | C | T | G | T | C | C | C | C | A | C | T | G | G | A | A | T | C | A | A | A | A | T | C | T | T | T | A | G | T | T | G | G | A | T | C | G | C | T | A | C | C | A | T | G | T | G | G | G | G | A |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | C | T | T | A | G | A | C | G | T | T | G | A | T | A | C | G | C | G | T | G | C | C | T | A | C | T | T | C | A | C | C | G | C | A | G | C | T | A | C | C | A | T | G | A | T | C | A | T | A | G | C | T | G | T | C | C | C | T | A | C | T | G | G | A | A | T | C | A | A | A | A | T | C | T | T | T | A | G | T | T | G | G | A | T | C | G | C | T | A | C | C | A | T | G | T | G | G | G | G | A |
| Magnolia stellata (U77622) | C | T | T | A | G | A | C | G | T | T | G | A | T | A | C | G | C | G | T | G | C | C | T | A | C | T | T | C | A | C | C | G | C | A | G | C | T | A | C | C | A | T | G | A | T | C | A | T | A | G | C | T | G | T | C | C | C | C | A | C | A | G | G | A | A | T | C | A | A | A | A | T | C | T | T | T | A | G | T | T | G | G | A | T | C | G | C | T | A | C | C | A | T | G | T | G | G | G | G | A |
| Pisum sativum (X1440) | C | T | T | A | G | A | C | G | T | T | G | A | T | A | C | C | C | G | T | G | C | C | T | A | C | T | T | C | A | C | C | G | C | T | G | C | T | A | C | C | A | T | G | A | T | C | A | T | A | G | C | T | G | T | C | C | C | C | A | C | T | G | G | A | A | T | T | A | A | A | A | T | A | T | T | T | A | G | T | T | G | G | A | T | C | G | C | T | A | C | C | A | T | G | T | G | G | G | G | G |
| Piper bicolor (AY009448) | C | T | T | A | G | A | C | G | T | T | G | A | T | A | C | G | C | G | T | G | C | C | T | A | C | T | T | C | A | C | C | G | C | A | G | C | T | A | C | C | A | T | G | A | T | C | A | T | A | G | C | G | G | T | C | C | C | C | A | C | T | G | G | A | A | T | C | A | A | A | A | T | C | T | T | T | A | G | T | T | G | G | A | T | C | G | C | T | A | C | C | A | T | G | T | G | G | G | G | A |
| Populus tremuloides (U77623) | C | T | T | A | G | A | C | G | T | T | G | A | T | A | C | C | C | G | T | G | C | C | T | A | C | T | T | C | A | C | C | G | C | A | G | C | T | A | C | C | A | T | G | A | T | C | A | T | A | G | C | T | G | T | C | C | C | C | A | C | T | G | G | A | A | T | C | A | A | A | A | T | C | T | T | T | A | G | T | T | G | G | A | T | C | G | C | T | A | C | C | A | T | G | T | G | G | G | G | G |
| Solanum tuberosum (AF096321) | C | T | T | A | G | A | C | G | T | T | G | A | T | A | C | C | C | G | T | G | C | C | T | A | C | T | T | C | A | C | C | G | C | A | G | C | T | A | C | C | A | T | G | A | T | C | A | T | A | G | C | T | G | T | C | C | C | C | A | C | T | G | G | A | A | T | C | A | A | A | A | T | C | T | T | T | A | G | T | T | G | G | A | T | C | G | C | T | A | C | C | A | T | G | T | G | G | G | G | G |
| Oryza sativa (X15990) | C | T | T | A | G | A | C | G | T | T | G | A | T | A | C | G | C | G | T | G | C | C | T | A | C | T | T | C | A | C | C | G | C | A | G | C | T | A | C | C | A | T | G | A | T | C | A | T | A | G | C | T | G | T | G | C | C | C | A | C | T | G | G | A | A | T | A | A | A | A | A | T | C | T | T | T | A | G | T | T | G | G | A | T | T | G | C | T | A | C | C | A | T | G | T | G | G | G | G | A |
| Sabel palmetto (U77624) | C | T | T | A | G | A | C | G | T | T | G | A | T | A | C | G | C | G | T | G | C | C | T | A | C | T | T | C | A | C | C | G | C | A | G | C | T | A | C | C | A | T | G | A | T | C | A | T | A | G | C | T | G | T | C | C | C | C | A | C | T | G | G | A | A | T | A | A | A | A | A | T | C | T | T | T | A | G | T | T | G | G | A | T | C | G | C | T | A | C | C | A | T | G | T | G | G | G | G | A |
| Glycine max (M16884) | C | T | T | A | G | A | C | G | T | G | G | A | T | A | C | C | C | G | T | G | C | C | T | A | C | T | T | C | A | C | C | G | C | A | G | C | T | A | C | C | A | T | G | A | T | C | A | T | A | G | C | T | G | T | C | C | C | C | A | C | T | G | G | A | A | T | T | A | A | A | A | T | C | T | T | T | A | G | T | T | G | G | A | T | C | G | C | T | A | C | C | A | T | G | T | G | G | G | G | G |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | C | T | T | A | G | A | C | G | T | T | G | A | T | A | C | C | C | G | T | G | C | C | T | A | C | T | T | C | A | C | C | G | C | A | G | C | T | A | C | C | A | T | G | A | T | C | A | T | A | G | C | T | G | T | C | C | C | C | A | C | T | G | G | A | A | T | C | A | A | A | A | T | C | T | T | T | A | G | T | T | G | G | A | T | C | G | C | T | A | C | C | A | T | G | T | G | G | G | G | G |
| Triticum aestivum (Y00417) | C | T | T | A | G | A | C | G | T | T | G | A | T | A | C | G | C | G | T | G | C | C | T | A | C | T | T | C | A | C | C | G | C | A | G | C | T | A | C | C | A | T | G | A | T | C | A | T | A | G | C | T | G | T | G | C | C | C | A | C | A | G | G | A | A | T | C | A | A | A | A | T | C | T | T | T | A | G | T | T | G | G | A | T | C | G | C | T | A | C | C | A | T | G | T | G | G | G | G | A |
| Zea mays (X02660) | C | T | T | A | G | A | C | G | T | T | G | A | T | A | C | G | C | G | T | G | C | C | T | A | C | T | T | C | A | C | C | G | C | A | G | C | T | A | C | C | A | T | G | A | T | C | A | T | A | G | C | T | G | T | G | C | C | C | A | C | T | G | G | A | A | T | C | A | A | A | A | T | C | T | T | T | A | G | T | T | G | G | A | T | C | G | C | T | A | C | C | A | T | G | T | G | G | G | G | A |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sites 2001 through 2100
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| Peperomia cubensis (AF029783) | G | G | T | T | C | G | A | T | A | C | A | A | T | A | C | A | A | A | A | C | A | C | C | A | A | T | G | T | T | A | T | T | T | G | C | T | G | T | A | G | G | G | T | C | C | A | T | C | T | T | T | T | T | G | T | T | C | A | C | C | A | T | A | G | G | A | G | G | A | C | T | C | A | C | T | G | G | A | A | T | A | G | T | C | C | C | G | G | C | G | A | A | T | T | C | T | G | G | G | C |
| Coffea arabica (AJ247586) | G | G | T | T | C | A | A | T | A | C | A | A | T | A | C | A | A | A | A | C | A | C | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | T | G | C | T | G | T | A | G | G | G | T | T | C | A | T | C | T | T | T | T | T | G | T | T | T | A | C | C | A | T | A | G | G | A | G | G | A | C | T | C | A | C | T | G | G | A | A | T | A | G | T | T | C | T | G | G | C | A | A | A | T | T | C | T | G | G | A | C |
| Linum sp ((AJ247604) | G | G | T | T | C | G | A | T | A | C | A | A | T | A | C | A | A | A | A | C | A | C | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | T | G | C | T | G | T | A | G | G | G | T | T | C | A | T | C | T | T | T | T | T | G | T | T | C | A | C | C | A | T | A | G | G | A | G | G | A | C | T | C | A | C | T | G | G | A | A | T | A | G | T | C | C | C | G | G | C | A | A | A | T | T | C | T | G | G | G | A |
| Musa nana (AJ247609) | G | G | T | T | C | G | A | T | A | C | A | A | T | T | C | A | A | A | A | C | A | C | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | T | G | C | A | G | T | A | G | G | G | T | C | C | A | T | C | T | T | T | T | T | G | T | T | C | A | C | T | A | T | A | G | G | A | G | G | G | C | T | C | A | C | T | G | G | A | A | T | A | G | T | T | C | T | A | G | C | A | A | A | T | T | C | C | G | G | G | C |
| Beta vulgaris (X57693) | G | G | T | T | C | G | A | T | A | C | A | A | T | A | C | A | A | A | A | C | A | C | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | T | G | C | T | G | T | A | G | G | G | T | T | C | A | T | C | T | T | T | T | T | G | T | T | C | A | C | C | G | T | A | G | G | A | G | G | A | C | T | C | A | C | T | G | G | A | A | T | A | G | T | C | C | T | G | G | C | T | A | A | T | T | C | T | G | G | G | C |
| Betula papyrifera (U77620) | G | G | T | T | C | G | A | T | A | C | A | A | T | A | C | A | A | A | A | C | A | C | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | T | G | C | T | G | T | A | G | G | G | T | C | C | A | T | C | T | T | T | T | T | G | T | T | C | A | C | C | A | T | A | G | G | A | G | G | A | C | T | C | A | C | T | G | G | A | A | T | A | G | T | C | C | C | G | G | C | A | A | A | T | T | C | T | G | G | G | C |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | G | G | T | T | C | G | A | T | A | C | A | A | T | A | C | A | A | A | A | C | A | C | C | A | A | T | G | T | T | A | T | T | T | G | C | T | G | T | A | G | G | G | T | T | C | A | T | C | T | T | T | T | T | G | T | T | C | A | C | C | A | T | A | G | G | A | G | G | A | C | T | C | A | C | T | G | G | A | A | T | A | G | T | C | C | T | G | G | C | A | A | A | T | T | C | A | G | G | G | C |
| Chamaerops humilis (U77621) | G | G | T | T | C | G | A | T | A | C | A | A | T | A | C | A | A | A | A | C | A | C | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | T | G | C | T | G | T | A | G | G | G | T | C | C | A | T | C | T | T | T | T | T | G | T | T | C | A | C | C | A | T | A | G | G | A | G | G | G | C | T | C | A | C | T | G | G | A | A | T | A | G | T | T | C | T | A | G | C | A | A | A | T | T | C | T | G | G | G | C |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | G | G | T | T | C | G | A | T | A | C | A | A | T | A | C | A | A | A | A | C | A | C | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | T | G | C | T | G | T | A | G | G | G | T | C | C | A | T | C | T | T | T | T | T | G | T | T | C | A | C | C | A | T | A | G | G | A | G | G | A | C | T | C | A | C | T | G | G | A | A | T | A | G | T | C | C | C | G | G | C | A | A | A | T | T | C | T | G | G | G | C |
| Magnolia stellata (U77622) | G | G | T | T | C | G | A | T | A | C | A | A | T | A | C | A | A | A | A | C | A | C | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | T | G | C | T | G | T | A | G | G | G | T | C | C | A | T | C | T | T | T | T | T | G | T | T | C | A | C | C | A | T | A | G | G | A | G | G | A | C | T | C | A | C | T | G | G | A | A | T | A | G | T | C | C | C | G | G | C | A | A | A | T | T | C | T | G | G | G | C |
| Pisum sativum (X1440) | G | G | T | T | C | G | A | T | A | C | A | A | T | A | C | A | A | A | A | C | A | C | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | T | G | C | T | G | T | A | G | G | G | T | T | C | A | T | C | T | T | T | T | T | G | T | T | C | A | C | C | A | T | A | G | G | A | G | G | A | C | T | C | A | C | T | G | G | A | A | T | A | G | T | C | C | C | G | G | C | A | A | A | T | T | C | A | G | G | G | C |
| Piper bicolor (AY009448) | G | G | T | T | C | G | A | T | A | C | A | A | T | A | C | A | A | A | A | C | A | C | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | T | G | C | T | G | T | A | G | G | G | T | C | C | A | T | C | T | T | T | T | T | G | T | T | C | A | C | C | A | T | A | G | G | A | G | G | A | C | T | C | A | C | T | G | G | A | A | T | A | G | T | C | C | T | G | G | C | A | A | A | T | T | C | T | G | G | G | C |
| Populus tremuloides (U77623) | G | G | T | T | C | G | A | T | A | C | A | A | T | A | C | A | A | A | A | C | A | C | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | T | G | C | T | G | T | A | G | G | G | T | T | C | A | T | C | T | T | T | T | T | G | T | T | C | A | C | C | A | T | A | G | G | A | G | G | A | C | T | C | A | C | A | G | G | A | A | T | A | G | T | C | C | T | G | G | C | A | A | A | T | T | C | T | G | G | G | C |
| Solanum tuberosum (AF096321) | G | G | T | T | C | G | A | T | A | C | A | A | T | A | C | A | A | A | A | C | A | C | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | T | G | C | T | G | T | A | G | G | G | T | T | C | A | T | C | T | T | T | T | T | A | T | T | C | A | C | C | A | T | A | G | G | A | G | G | A | C | T | C | A | C | T | G | G | A | A | T | A | G | T | T | C | T | G | G | C | T | A | A | T | T | C | T | G | G | G | C |
| Oryza sativa (X15990) | G | G | T | T | C | G | A | T | A | C | A | A | T | A | C | A | A | A | A | C | A | C | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | T | G | C | T | G | T | A | G | G | G | T | T | C | A | T | C | T | T | T | T | T | G | T | T | C | A | C | C | A | T | A | G | G | A | G | G | G | C | T | C | A | C | T | G | G | A | A | T | T | G | T | T | C | T | A | G | C | A | A | A | C | T | C | T | G | G | G | C |
| Sabel palmetto (U77624) | G | G | T | T | C | G | A | T | A | C | A | A | T | A | C | A | A | A | A | C | A | C | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | T | G | C | T | G | T | A | G | G | G | T | C | C | A | T | C | T | T | T | T | T | G | T | T | C | A | C | C | A | T | A | G | G | A | G | G | G | C | T | C | A | C | T | G | G | A | A | T | A | G | T | T | C | T | A | G | C | A | A | A | T | T | C | T | G | G | G | C |
| Glycine max (M16884) | G | G | T | T | C | G | A | T | A | C | A | A | T | A | C | A | A | A | A | C | A | C | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | T | G | C | T | G | T | A | G | G | G | T | T | C | A | T | C | T | T | T | T | T | G | T | T | C | A | C | C | A | T | A | G | G | A | G | G | A | C | T | C | A | C | T | G | G | A | A | T | A | G | T | C | C | T | G | G | C | A | A | A | T | T | C | T | G | G | G | C |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | G | G | T | T | C | G | A | T | A | C | A | A | T | A | C | A | A | A | A | C | A | C | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | T | G | C | T | G | T | A | G | G | G | T | T | C | A | T | C | T | T | T | T | T | A | T | T | C | A | C | C | A | T | A | G | G | A | G | G | A | C | T | C | A | C | T | G | G | A | A | T | A | G | T | T | C | T | G | G | C | T | A | A | T | T | C | T | G | G | G | C |
| Triticum aestivum (Y00417) | G | G | T | T | C | G | A | T | A | C | A | A | T | A | C | A | A | A | A | C | A | C | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | T | G | C | T | G | T | A | G | G | G | T | T | C | A | T | C | T | T | T | T | T | G | T | T | C | A | C | C | A | T | A | G | G | A | G | G | G | C | T | C | A | C | T | G | G | A | A | T | A | G | T | T | C | T | A | G | C | A | A | A | C | T | C | T | G | G | G | C |
| Zea mays (X02660) | G | G | T | T | C | G | A | T | A | C | A | A | T | A | C | A | A | A | A | C | A | C | C | C | A | T | G | T | T | A | T | T | T | G | C | T | G | T | A | G | G | G | T | T | C | A | T | C | T | T | T | T | T | G | T | T | C | A | C | C | A | T | A | G | G | A | G | G | G | C | T | C | A | C | T | G | G | A | A | T | A | G | T | T | C | T | A | G | C | A | A | A | C | T | C | T | G | G | G | C |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sites 2101 through 2200
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| Peperomia cubensis (AF029783) | T | A | G | A | C | A | T | T | G | C | T | C | T | A | C | A | T | G | A | T | A | C | T | T | A | T | T | A | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Coffea arabica (AJ247586) | T | A | G | A | C | A | T | T | G | C | T | C | T | A | C | A | T | G | A | T | A | C | T | T | A | T | T | A | T | G | T | A | G | T | T | G | C | A | C | A | T | T | T | C | C | A | T | T | A | T | G | T | A | C | T | T | T | C | T | A | T | G | G | G | A | G | C | C | G | T | T | T | T | T | G | C | T | T | T | A | T | T | T | G | C | A | G | G | A | T | T | T | C | A | C | T | A | T | T | G |
| Linum sp ((AJ247604) | T | A | G | A | C | A | T | T | G | C | T | T | T | A | C | A | T | G | A | T | A | C | T | T | A | T | T | A | T | G | T | G | G | T | T | G | C | G | C | A | T | T | T | C | C | A | T | T | A | T | G | T | A | C | T | T | T | C | T | A | T | G | G | G | A | G | C | C | G | T | T | T | T | T | G | C | T | T | T | A | T | T | T | G | C | A | G | G | A | T | T | T | C | A | C | T | A | T | T | G |
| Musa nana (AJ247609) | T | A | G | A | C | A | T | T | G | C | T | C | T | A | C | A | T | G | A | T | A | C | T | T | A | T | T | A | T | G | T | A | G | T | T | G | C | A | C | A | T | T | T | C | C | A | T | T | A | T | G | T | A | C | T | C | T | C | T | A | T | G | G | G | A | G | C | C | G | T | T | T | T | T | G | C | T | T | T | A | T | T | T | G | C | A | G | G | A | T | T | T | C | A | C | T | A | T | T | G |
| Beta vulgaris (X57693) | T | A | G | A | C | A | T | T | G | C | T | C | T | A | C | A | T | G | A | C | A | C | T | T | A | T | T | A | T | G | T | G | G | T | T | G | C | A | C | A | T | T | T | C | C | A | T | T | A | T | G | T | A | C | T | T | T | C | T | A | T | G | G | G | A | G | C | C | G | T | T | T | T | T | G | C | T | T | T | A | T | T | T | G | C | A | G | G | A | T | T | T | T | A | C | T | A | T | T | G |
| Betula papyrifera (U77620) | T | A | G | A | C | A | T | T | G | C | T | C | T | A | C | A | T | G | A | T | A | C | T | T | A | T | T | A | T | G | C | G | G | T | T | G | C | A | C | A | T | T | T | C | C | A | T | T | A | T | G | T | A | C | T | C | T | C | T | A | T | G | G | G | A | G | C | C | G | T | T | T | T | T | G | C | T | T | T | A | T | T | T | G | C | A | G | G | A | T | T | T | C | A | C | T | A | T | T | G |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | T | A | G | A | C | A | T | T | G | C | T | C | T | A | C | A | T | G | A | T | A | C | T | T | A | T | T | A | T | G | T | G | G | T | T | G | C | A | C | A | T | T | T | C | C | A | T | T | A | T | G | T | A | C | T | T | T | C | T | A | T | G | G | G | A | G | C | C | G | T | T | T | T | T | G | C | T | T | T | A | T | T | T | G | C | A | G | G | A | T | T | T | C | A | C | T | A | T | T | G |
| Chamaerops humilis (U77621) | T | A | G | A | C | A | T | T | G | C | T | C | T | A | C | A | T | G | A | T | A | C | T | T | A | T | T | A | T | G | T | G | G | T | T | G | C | A | C | A | T | T | T | C | C | A | T | T | A | T | G | T | A | C | T | T | T | C | T | A | T | G | G | G | A | G | C | C | G | T | T | T | T | T | G | C | T | T | T | A | T | T | T | G | C | A | G | G | A | T | T | T | T | A | C | T | A | T | T | G |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | T | A | G | A | C | A | T | T | G | C | T | C | T | A | C | A | T | G | A | T | A | C | T | T | A | T | T | A | T | G | C | G | G | T | T | G | C | A | C | A | T | T | T | C | C | A | T | T | A | T | G | T | A | C | T | T | T | C | T | A | T | G | G | G | A | G | C | C | G | T | T | T | T | T | G | C | T | T | T | A | T | T | T | G | C | A | G | G | A | T | T | T | C | A | C | T | A | T | T | G |
| Magnolia stellata (U77622) | T | A | G | A | C | A | T | T | G | C | T | C | T | A | C | A | T | G | A | T | A | C | T | T | A | T | T | A | T | G | C | G | G | T | T | G | C | A | C | A | T | T | T | C | C | A | T | T | A | T | G | T | A | C | T | T | T | C | T | A | T | G | G | G | A | G | C | C | G | T | T | C | T | T | G | C | T | T | T | A | T | T | T | G | C | A | G | G | A | T | T | T | C | A | C | T | A | T | T | G |
| Pisum sativum (X1440) | T | A | G | A | C | A | T | T | G | C | T | C | T | A | C | A | T | G | A | T | A | C | T | T | A | T | T | A | T | G | T | G | G | T | T | G | C | A | C | A | T | T | T | C | C | A | T | T | A | T | G | T | A | C | T | T | T | C | T | A | T | G | G | G | A | G | C | C | G | T | T | T | T | T | G | C | T | T | T | A | T | T | T | G | C | A | G | G | A | T | T | T | C | A | C | T | A | T | T | G |
| Piper bicolor (AY009448) | T | A | G | A | C | A | T | T | G | C | T | C | T | A | C | A | T | G | A | T | A | C | T | T | A | T | T | A | T | G | C | G | G | T | T | G | C | A | C | A | T | T | T | C | C | A | T | T | A | T | G | T | A | C | T | T | T | C | T | A | T | G | G | G | A | G | C | C | G | T | T | T | T | T | G | C | T | T | T | A | T | T | T | G | C | A | G | G | A | T | T | T | C | A | C | T | A | T | T | G |
| Populus tremuloides (U77623) | T | A | G | A | C | A | T | T | G | C | T | C | T | A | C | A | T | G | A | T | A | C | T | T | A | T | T | A | T | G | T | G | G | T | T | G | C | A | C | A | T | T | T | C | C | A | T | T | A | T | G | T | A | C | T | T | T | C | T | A | T | G | G | G | A | G | C | C | G | T | T | T | T | T | G | C | T | T | T | A | T | T | T | G | C | A | G | G | A | T | T | T | T | A | C | T | A | T | T | G |
| Solanum tuberosum (AF096321) | T | A | G | A | C | A | T | T | G | C | T | C | T | A | C | A | T | G | A | T | A | C | T | T | A | T | T | A | T | G | T | G | G | T | T | G | C | A | C | A | T | T | T | C | C | A | T | T | A | T | G | T | A | C | T | T | T | C | T | A | T | G | G | G | A | G | C | C | G | T | T | T | T | T | G | C | T | T | T | A | T | T | T | G | C | A | G | G | A | T | T | T | C | A | C | T | A | T | T | G |
| Oryza sativa (X15990) | T | A | G | A | C | A | T | T | G | C | T | C | T | A | C | A | T | G | A | T | A | C | T | T | A | T | T | A | T | G | T | G | G | T | T | G | C | A | C | A | T | T | T | C | C | A | T | T | A | T | G | T | A | C | T | T | T | C | T | A | T | G | G | G | A | G | C | C | G | T | T | T | T | T | G | C | T | T | T | A | T | T | T | G | C | T | G | G | A | T | T | T | T | A | C | T | A | T | T | G |
| Sabel palmetto (U77624) | T | A | G | A | C | A | T | T | G | C | T | C | T | A | C | A | T | G | A | T | A | C | T | T | A | T | T | A | T | G | T | G | G | T | T | G | C | A | C | A | T | T | T | C | C | A | T | T | A | T | G | T | A | C | T | T | T | C | T | A | T | G | G | G | A | G | C | C | G | T | T | T | T | T | G | C | T | T | T | A | T | T | T | G | C | A | G | G | A | T | T | T | T | A | C | T | A | T | T | G |
| Glycine max (M16884) | T | A | G | A | C | A | T | T | G | C | T | C | T | A | C | A | T | G | A | T | A | C | T | T | A | T | T | A | T | G | T | G | G | T | T | G | C | A | C | A | T | T | T | C | C | A | T | T | A | T | G | T | A | C | T | T | T | C | T | A | T | G | G | G | A | G | C | C | G | T | T | T | T | T | G | C | T | T | T | A | T | T | T | G | C | A | G | G | A | T | T | T | C | A | C | T | A | T | T | G |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | T | A | G | A | C | A | T | T | G | C | T | C | T | A | C | A | T | G | A | T | A | C | T | T | A | T | T | A | T | G | T | G | G | T | T | G | C | A | C | A | T | T | T | C | C | A | T | T | A | T | G | T | A | C | T | T | T | C | T | A | T | G | G | G | A | G | C | C | G | T | T | T | T | T | G | C | T | T | T | A | T | T | T | G | C | A | G | G | A | T | T | T | C | A | C | T | A | T | T | G |
| Triticum aestivum (Y00417) | T | A | G | A | C | A | T | T | G | C | T | C | T | A | C | A | T | G | A | T | A | C | T | T | A | T | T | A | T | G | T | G | G | T | T | G | C | A | C | A | T | T | T | C | C | A | T | T | A | T | G | T | A | C | T | T | T | C | T | A | T | G | G | G | A | G | C | C | G | T | T | T | T | T | G | C | T | T | T | A | T | T | T | G | C | T | G | G | A | T | T | T | T | A | C | T | A | T | T | G |
| Zea mays (X02660) | T | A | G | A | C | A | T | T | G | C | T | C | T | A | C | A | T | G | A | T | A | C | T | T | A | T | T | A | T | G | T | G | G | T | T | G | C | A | C | A | T | T | T | C | C | A | T | T | A | T | G | T | A | C | T | T | T | C | T | A | T | G | G | G | A | G | C | C | G | T | T | T | T | T | G | C | T | T | T | A | T | T | T | G | C | T | G | G | A | T | T | T | T | A | C | T | A | T | T | G |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sites 2201 through 2300
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| Peperomia cubensis (AF029783) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Coffea arabica (AJ247586) | G | G | T | A | G | G | T | A | A | A | A | T | C | T | T | T | G | G | T | C | G | G | A | C | A | T | A | C | C | C | T | G | A | A | A | C | T | T | T | A | G | G | T | C | A | A | A | T | C | C | A | T | T | T | T | T | G | G | A | T | A | A | C | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | G | T | T | A | A | T | C | T | G | A | C | C | T | T | C | T | T | T | C | C | C | A | T | G | C | A | T |
| Linum sp ((AJ247604) | G | G | T | G | G | G | T | A | A | A | A | T | C | T | T | T | G | G | T | C | G | G | A | C | A | T | A | C | C | C | G | G | A | A | A | C | T | T | T | A | G | G | T | C | A | A | A | T | C | C | A | T | T | T | T | T | G | G | A | T | C | A | C | T | T | T | T | T | T | C | G | G | G | G | T | T | A | A | T | C | C | G | A | C | C | T | T | C | T | T | T | C | C | C | A | T | G | C | A | T |
| Musa nana (AJ247609) | G | G | T | G | G | G | T | A | A | A | A | T | C | T | T | T | G | G | T | C | G | G | A | C | A | T | A | C | C | C | T | G | A | A | A | C | T | T | T | A | G | G | A | C | A | A | A | T | N | C | A | T | T | T | C | T | G | G | A | T | C | A | C | T | T | C | T | T | T | C | G | G | G | G | T | T | A | A | T | C | T | G | A | C | C | T | T | C | T | T | T | C | C | C | A | T | G | C | A | T |
| Beta vulgaris (X57693) | G | G | T | G | G | G | C | A | A | A | A | T | C | T | T | T | G | G | T | C | G | A | A | C | A | T | A | C | C | C | T | G | A | A | A | C | T | T | T | A | G | G | T | C | A | A | A | T | C | C | A | T | T | T | T | T | G | G | A | T | C | A | C | T | T | T | T | T | T | C | G | G | G | G | T | T | A | A | T | C | T | T | A | C | C | T | T | C | T | T | C | C | C | C | A | T | G | C | A | T |
| Betula papyrifera (U77620) | G | G | T | G | G | G | T | A | A | A | A | T | C | T | T | T | G | G | T | C | G | G | A | C | A | T | A | C | C | C | T | G | A | A | A | C | T | T | T | A | G | G | T | C | A | A | A | T | C | C | A | T | T | T | T | T | G | G | A | T | C | A | C | T | T | T | T | T | T | C | G | G | G | G | T | T | A | A | T | C | T | G | A | C | C | C | T | C | T | T | T | C | C | C | A | T | G | C | A | T |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | G | G | T | G | G | G | T | A | A | A | A | T | C | T | T | T | G | G | T | C | G | G | A | C | A | T | A | C | C | C | T | G | A | A | A | C | T | T | T | G | G | G | T | C | A | A | A | T | C | C | A | T | T | T | T | T | G | G | A | T | C | A | C | T | T | T | T | T | T | C | G | G | G | G | T | T | A | A | T | C | T | G | A | C | C | T | T | C | T | T | T | C | C | C | A | T | G | C | A | T |
| Chamaerops humilis (U77621) | G | G | G | G | G | G | A | A | A | A | A | T | C | T | T | T | G | G | T | C | G | G | A | C | A | T | A | C | C | C | T | G | A | A | A | C | T | T | T | A | G | G | C | C | A | A | A | T | C | C | A | T | T | T | T | T | G | G | A | T | C | A | C | T | T | C | T | T | T | C | G | G | G | G | T | T | A | A | T | C | C | G | A | C | C | C | T | C | T | T | T | C | C | C | A | T | G | C | A | T |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | G | G | T | G | G | G | T | A | A | A | A | T | C | T | T | T | G | G | T | C | G | G | A | C | A | T | A | C | C | C | T | G | A | A | A | C | T | T | T | A | G | G | T | C | A | A | A | T | C | C | A | T | T | T | T | T | G | G | A | T | C | A | C | T | T | C | T | T | T | C | G | G | G | G | T | T | A | A | T | C | C | G | A | C | C | C | T | C | T | T | T | C | C | C | A | T | G | C | A | T |
| Magnolia stellata (U77622) | G | G | T | G | G | G | T | A | A | A | A | T | C | T | T | T | G | G | T | C | G | G | A | C | A | T | A | C | C | C | T | G | A | A | A | C | T | C | T | A | G | G | T | C | A | A | A | T | C | C | A | T | T | T | T | T | G | G | A | T | C | A | C | T | T | C | T | T | T | C | G | G | G | G | T | T | A | A | T | C | C | G | A | C | C | C | T | C | T | T | T | C | C | C | A | T | G | C | A | T |
| Pisum sativum (X1440) | G | G | T | G | G | G | T | A | A | A | A | T | C | T | T | T | G | G | T | C | G | G | A | C | A | T | A | C | C | C | T | G | A | A | A | C | T | T | T | A | G | G | T | A | A | A | A | T | C | C | A | T | T | T | T | T | G | G | A | T | C | A | C | T | T | T | T | T | T | C | G | G | G | G | T | T | A | A | T | C | T | G | A | C | C | C | T | C | T | T | T | C | C | C | A | T | G | C | A | T |
| Piper bicolor (AY009448) | G | G | T | G | G | G | T | A | A | A | A | T | C | T | T | T | G | G | T | C | G | G | A | C | A | T | A | C | C | C | T | G | A | A | A | C | T | T | T | A | G | G | T | C | A | A | A | T | C | C | A | T | T | T | T | T | G | G | A | T | C | A | C | T | T | C | T | T | T | C | G | G | A | G | T | T | A | A | T | C | C | G | A | C | C | C | T | C | T | T | T | C | C | C | A | T | G | C | A | T |
| Populus tremuloides (U77623) | G | G | T | G | G | G | T | A | A | A | A | T | C | A | C | A | G | G | T | C | G | G | A | C | A | T | A | C | C | C | T | G | A | A | A | C | G | T | T | A | G | G | G | A | A | A | A | T | C | C | A | T | T | T | T | T | G | G | A | T | C | A | C | T | T | T | T | T | T | C | G | G | G | G | T | G | A | A | T | C | T | T | A | C | C | T | T | C | T | T | T | C | C | T | A | T | G | C | A | T |
| Solanum tuberosum (AF096321) | G | G | T | A | G | G | T | A | A | A | A | T | C | T | T | T | G | G | T | C | G | G | A | C | A | T | A | C | C | C | T | G | A | A | A | C | T | T | T | A | G | G | T | C | A | A | A | T | C | C | A | T | T | T | T | T | G | G | A | T | C | A | C | C | T | T | T | T | T | C | G | G | G | G | T | T | A | A | T | A | T | G | A | C | C | T | T | C | T | T | T | C | C | T | A | T | G | C | A | T |
| Oryza sativa (X15990) | G | G | T | G | G | G | T | A | A | A | A | T | C | T | T | T | G | G | T | C | G | G | A | C | A | T | A | T | C | C | T | G | A | A | A | C | T | T | T | A | G | G | C | C | A | A | A | T | C | C | A | T | T | T | T | T | G | G | A | T | T | A | C | T | T | T | T | T | T | C | G | G | G | G | T | T | A | A | T | C | T | G | A | C | C | T | T | C | T | T | T | C | C | C | A | T | G | C | A | T |
| Sabel palmetto (U77624) | G | G | T | G | G | G | T | A | A | A | A | T | C | T | T | T | G | G | T | C | G | G | A | C | A | T | A | C | C | C | T | G | A | A | A | C | T | T | T | A | G | G | C | C | A | A | A | T | C | C | A | T | T | T | T | T | G | G | A | T | C | A | C | T | T | C | T | T | T | C | G | G | G | G | T | T | A | A | T | C | C | G | A | C | C | C | T | C | T | T | T | C | C | C | A | T | G | C | A | T |
| Glycine max (M16884) | G | G | T | G | G | G | T | A | A | A | A | T | C | T | T | T | G | G | T | C | G | G | A | C | A | T | A | C | C | C | T | G | A | A | A | C | T | T | T | A | G | G | T | C | A | A | A | T | C | C | A | T | T | T | T | T | G | G | A | T | C | A | C | T | T | T | T | T | T | C | G | G | G | G | T | T | A | A | T | C | T | G | A | C | C | C | T | C | T | T | T | C | C | C | A | T | G | C | A | T |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | G | G | T | A | G | G | T | A | A | A | A | T | C | T | T | T | G | G | T | C | G | G | A | C | A | T | A | C | C | C | T | G | A | A | A | C | T | T | T | A | G | G | T | C | A | A | A | T | C | C | A | T | T | T | T | T | G | G | A | T | C | A | C | C | T | T | T | T | T | C | G | G | G | G | T | T | A | A | T | A | T | G | A | C | C | T | T | C | T | T | T | C | C | T | A | T | G | C | A | T |
| Triticum aestivum (Y00417) | G | G | T | G | G | G | T | A | A | A | A | T | C | T | T | T | G | G | T | C | G | G | A | C | A | T | A | T | C | C | T | G | A | A | A | C | T | T | T | A | G | G | C | C | A | A | A | T | C | C | A | T | T | T | T | T | G | G | A | T | C | A | C | T | T | T | T | T | T | C | G | G | G | G | T | T | A | A | T | C | T | G | A | C | C | T | T | C | T | T | T | C | C | C | A | T | G | C | A | T |
| Zea mays (X02660) | G | G | T | G | G | G | T | A | A | A | A | T | C | T | T | T | G | G | T | C | G | G | A | C | A | T | A | T | C | C | T | G | A | A | A | C | T | T | T | A | G | G | C | C | A | A | A | T | C | C | A | T | T | T | T | T | G | G | A | T | C | A | C | T | T | T | T | T | T | C | G | G | G | G | T | T | A | A | T | C | T | G | A | C | C | T | T | C | T | T | T | C | C | C | A | T | G | C | A | T |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sites 2301 through 2351
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| Peperomia cubensis (AF029783) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Coffea arabica (AJ247586) | T | T | C | T | T | A | G | G | G | C | T | T | T | C | G | G | G | T | A | T | G | C | C | A | C | G | T | C | G | C | A | T | T | C | C | A | G | A | T | T | A | T | C | C | A | G | A | T | G | C | T |
| Linum sp ((AJ247604) | T | T | C | T | T | A | G | G | G | C | T | T | T | C | G | G | G | T | A | T | G | C | C | A | C | G | T | C | G | C | A | T | T | C | C | A | G | A | T | T | A | T | C | C | A | G | A | T | G | C | T |
| Musa nana (AJ247609) | T | T | C | T | T | A | G | G | G | C | T | A | T | C | G | G | G | T | A | T | G | C | C | T | C | G | T | C | G | C | A | T | T | C | C | C | G | A | T | C | A | T | C | C | N | G | A | T | G | C | C |
| Beta vulgaris (X57693) | T | T | T | T | T | A | G | G | G | C | T | T | T | C | G | G | G | T | A | T | G | C | C | A | C | G | T | C | G | C | A | T | T | C | C | C | G | A | T | T | A | T | C | C | A | G | A | T | G | C | T |
| Betula papyrifera (U77620) | T | T | C | T | T | A | G | G | G | C | T | T | T | C | G | G | G | T | A | T | G | C | C | A | C | G | T | C | G | C | A | T | T | C | C | A | G | A | T | T | A | T | C | C | A | G | A | T | G | C | T |
| Brexia madagascariensis (AJ223413) | T | T | C | T | T | A | G | G | G | C | T | T | T | C | G | G | G | T | A | T | G | C | C | A | C | G | T | C | G | C | A | T | T | C | C | A | G | A | T | T | A | T | C | C | A | G | A | T | G | C | T |
| Chamaerops humilis (U77621) | T | T | C | T | T | A | G | G | G | C | T | T | T | C | G | G | G | T | A | T | G | C | C | A | C | G | T | C | G | C | A | T | T | C | C | A | G | A | T | T | A | T | C | C | A | G | A | T | G | C | T |
| Cinnamomum zeylanicum (AY009440) | T | T | C | T | T | A | G | G | G | C | T | T | T | C | G | G | G | T | A | T | G | C | C | A | C | G | T | C | G | C | A | T | T | C | C | A | G | A | T | T | A | T | C | C | A | G | A | T | G | C | T |
| Magnolia stellata (U77622) | T | T | C | T | T | A | G | G | G | C | T | T | T | C | G | G | G | T | A | T | G | C | C | A | C | G | T | C | G | C | A | T | T | C | C | A | G | A | T | T | A | T | C | C | A | G | A | T | G | C | T |
| Pisum sativum (X1440) | T | T | C | T | T | A | G | G | G | C | T | T | T | C | G | G | G | T | A | T | G | C | C | A | C | G | T | C | G | C | A | T | T | C | C | A | G | A | T | T | A | T | C | C | A | G | A | T | G | C | T |
| Piper bicolor (AY009448) | T | T | C | T | T | A | G | G | G | C | T | T | T | C | G | G | G | T | A | T | G | C | C | A | C | G | T | C | G | C | A | T | T | C | C | A | G | A | T | T | T | T | C | C | A | G | A | T | G | C | T |
| Populus tremuloides (U77623) | T | T | C | T | T | A | G | G | G | C | T | T | T | C | G | G | G | T | A | T | G | C | C | A | C | G | T | C | G | C | A | T | T | C | C | A | G | A | T | T | A | T | C | C | A | G | A | T | G | C | T |
| Solanum tuberosum (AF096321) | T | T | C | T | T | A | G | G | G | C | T | T | T | C | G | G | G | T | A | T | G | C | C | A | C | G | T | C | G | C | A | T | T | C | C | A | G | A | T | T | A | T | C | C | A | G | A | T | G | C | T |
| Oryza sativa (X15990) | T | T | C | T | T | A | G | G | G | C | T | T | T | C | G | G | G | C | A | T | G | C | C | A | C | G | T | C | G | C | A | T | T | C | C | A | G | A | T | T | A | T | C | C | A | G | A | T | G | C | T |
| Sabel palmetto (U77624) | T | T | C | T | T | A | G | G | G | C | T | T | T | C | G | G | G | T | A | T | G | C | C | A | C | G | T | C | G | C | A | T | T | C | C | A | G | A | T | T | A | T | C | C | A | G | A | T | G | C | T |
| Glycine max (M16884) | T | T | C | T | T | A | G | G | G | C | T | T | T | C | G | G | G | T | A | T | G | C | C | A | C | G | T | C | G | C | A | T | T | C | C | A | G | A | T | T | A | T | C | C | A | G | A | T | G | C | T |
| Lycopersicum esculentum (X54738) | T | T | C | T | T | A | G | G | G | C | T | T | T | C | G | G | G | T | A | T | G | C | C | A | C | G | T | C | G | C | A | T | T | C | C | A | G | A | T | T | A | T | C | C | A | G | A | T | G | C | T |
| Triticum aestivum (Y00417) | T | T | C | T | T | A | G | G | G | C | T | T | T | C | G | G | G | T | A | T | G | C | C | A | C | G | T | C | G | C | A | T | T | C | C | A | G | A | T | T | A | T | C | C | A | G | A | T | G | C | T |
| Zea mays (X02660) | T | T | C | T | T | A | G | G | G | C | T | T | T | C | G | G | G | T | A | T | G | C | C | A | C | G | T | C | G | C | A | T | T | C | C | A | G | A | T | T | A | T | C | C | A | G | A | T | G | C | T |
| FMPl-2b (forward) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-3b (reverse) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| FMPl-6 (alternative forward?) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |