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Científicos
del ARS han desarrollado algunas bases de datos ahora disponibles en
línea que ofrecen información genómica sobre los
arándanos y el maíz.
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Científicos producen bases de datos
disponibles en línea sobre el maíz y los
arándanos
Por
Rosalie Marion Bliss
7 de agosto 2008
Científicos del
Servicio de
Investigación Agrícola (ARS) y sus colegas han producido dos
recursos bioinformáticos disponibles en línea para ayudar a los
criadores de plantas y otros científicos a investigar las
características genéticas en varias especies de plantas. La
bioinformática es un campo de ciencia que combina la biología y
la informática para formar una sola disciplina.
Investigadores
Doreen
Ware,
Edward
Buckler,
Michael
McMullen y
James
Holland, quienes trabajan con el ARS, y sus colegas universitarios
produjeron Panzea, un recurso
bioinformático disponible en línea sobre la diversidad
genética del maíz, con el apoyo del
Departamento
de Agricultura de EE.UU. (USDA por sus siglas en inglés) y la
Fundación Nacional de Ciencia. Buckler
y Ware trabajan en un laboratorio mantenido por el ARS en Ithaca, Nueva York;
McMullen trabajan en Columbia, Misurí; y Holland trabajan en Raleigh,
Carolina del Norte.
Panzea contiene millones de puntos de datos y provee acceso a datos
relacionados con genotipos, fenotipos y polimorfismos.
El maíz es una especie diversa. Por término medio, dos
diferentes líneas de maíz pueden ser tan diferentes
genéticamente como el humano o el chimpancé. Un aspecto clave del
programa es identificar las regiones de cromosomas donde las líneas
exóticas de maíz tienen genes que proveen efectos
agronómicos que son superiores a aquellos en las líneas de
maíz ahora cultivadas en el área principal de producción
de maíz en EE.UU.
Panzea está disponible en: http://www.panzea.org.
Otra base de datos genómicos es útil a los criadores del
arándano que están produciendo plantas que pueden adaptarse en
una gama amplia de suelos, climas y épocas de cosecha. El
arándano es un cultivo principal de bayas, y las ventas están
aumentando rápidamente, según expertos.
Jeannine
Rowland, quien es genetista de plantas con el ARS, y sus colegas produjeron
la base de datos genómicos del arándano. Esta base de datos,
disponible en línea, se llama
BBGD.
Los investigadores trabajan en el
Laboratorio
del Mejoramiento Genético de Frutas y Verduras mantenido por el ARS
en Beltsville, Maryland. Ellos han identificado las secuencias genéticas
y los marcadores moleculares de importancia hortícola en el
arándano. Esta información está disponible mediante BBGD
para la crianza asistida por marcadores.
La base de datos provee información clave sobre la
expresión de genes relacionados con la capacidad de la planta de
aclimatarse y sobrevivir durante los inviernos fríos--una etapa
imprescindible para buenos rendimientos durante el verano. BBGD está
disponible en: http://psi081.ba.ars.usda.gov/bbgd/index.htm.
Lea
más sobre esta investigación en la revista 'Agricultural
Research' de agosto del 2008.
ARS es una agencia de investigaciones científicas del USDA.
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