"La caja de herramientas para los cultivadores de nuevas variedades de soya" es un recurso en línea para datos genéticos sobre una de las cosechas agrícolas más versátiles.

Una "caja de herramientas" está disponible en línea para estudios de la soya

Por Luis Pons
25 de septiembre 2006

Los cultivadores de nuevas variedades de soya, los productores y los científicos tienen una nueva "caja de herramientas".

Los científicos del Servicio de Investigación Agrícola (ARS) en Ames, Iowa, recientemente lanzaron "La caja de herramientas para los cultivadores de nuevas variedades de soya". Esta es una base de datos disponible en línea que permite la exploración de la composición genética de la soya mediante información fácilmente recuperada. ARS es la agencia principal de investigaciones científicas del Departamento de Agricultura de EE.UU. (USDA por sus siglas en inglés).

El sitio Web es la nueva interfaz a la base de datos pionera llamada 'SoyBase'. Esta base de datos sobre la genética de plantas fue establecida en 1993 y es sostenida por ARS. Es accesible en http://soybase.org/.

Según el biólogo computacional Rex Nelson del ARS, quien ayudó a diseñar la "caja de herramientas", esta base de datos ofrece acceso remoto más fácil a la información en SoyBase, y permite el uso de preguntas complejas para recuperar juegos de datos relacionados.

El sitio nuevo hace posible la comparación de mapas genéticos actuales de la soya, y permitirá el estudio de nuevos mapas de otras especies de legumbres cuando sean disponibles, según Nelson. Él trabaja en la Unidad de Investigación de Insectos de Maíz y la Genética de Cosechas (CICGRU por sus siglas en inglés) mantenida por ARS en Ames. El sitio usa un programa llamado 'CMap' que permite la comparación de mapas de fuentes múltiples. CMap fue creado por el proyecto 'Base de Datos de Organismos Modelos Genéricos' sostenido por el USDA.

En "La caja de herramientas para los cultivadores de nuevas variedades de soya", hay información sobre marcadores moleculares en mapas genéticos; enfermedades e insectos que atacan las plantas de soya; y muchos otros temas. La base de datos también incluye datos asociados con los rasgos cuantitativos de soya, tales como la resistencia de diferentes genotipos de soya a las tensiones tales como ataques por bacterias, hongos o insectos, la sequía, y la inundación.

Nelson explicó que las conexiones fáciles entre la caja de herramientas y otras bases de datos hacen más fácil combinar información de otras bases de datos en un solo reporte. Esta capacidad ayuda a los investigadores a rápidamente encontrar las secuencias genómicas asociadas con rasgos agronómicos específicos de interés. Finalmente, la caja de herramientas puede ayudar a hacer posible el desarrollo de variedades de soya con rasgos superiores.

El sitio Web se pondrá al día con nuevos datos a la vez que son publicados y con nuevas funciones solicitadas por las personas involucradas en el desarrollo y la producción de nuevas variedades de soya.

Los genetistas David Grant y Randy Shoemaker de la CICGRU ayudaron a poner en línea "la caja de herramientas". Grant es el conservador de SoyBase.