Una puerca y sus cerditos. Una puerca y sus cerditos.

Base de datos sobre los genes de cerdos apoya los estudios de nutrición y la inmunidad de humanos

Por Jim Core
26 de agosto 2005

Una base de datos investigable que permite la comparación de 2,600 proteínas y genes anotados de cerdos fue lanzada hoy por los científicos del Servicio de Investigación Agrícola (ARS). Estos genes son específicamente relacionados a la nutrición y la inmunidad.

El recurso nuevo se llama 'Porcine Immunology and Nutrition (PIN) Database' (Base de Datos Sobre la Inmunología y Nutrición de Cerdos) y está disponible en Internet en:

http://www.ars.usda.gov/Services/docs.htm?docid=6065

Los cerdos y los humanos comparten características de anatomía y fisiología que son útiles para modelar el efecto de nutrición en el funcionamiento del sistema de inmunidad y la reacción a enfermedades. En algunos casos, estudios que son difíciles o imposibles de hacer en humanos pueden ser realizados en los cerdos.

Pero datos moleculares y basados en el genoma del cerdo no pueden ser comparados con las bases de datos sofisticadas sobre los humanos o los roedores. Esto es porque las bases de datos existentes acerca del cerdo no son bien anotadas sobre los genes relacionados a la nutrición o la inmunidad. Con la disponibilidad de información sobre los genes y las proteínas de los cerdos, los investigadores pueden comparar los patrones de expresión de genes en los cerdos con la información más extensa provista en las bases de datos sobre los humanos y los roedores.

La base de datos fue producida por expertos de nutrición en el Centro Beltsville de Investigación de Nutrición Humana, mantenido por ARS en Beltsville, Maryland, y inmunólogos en el Instituto de Investigación de Animales y Recursos Naturales, también mantenido por ARS en Beltsville. Harry Dawson fue el líder del grupo. ARS es la agencia principal de investigaciones científicas del Departamento de Agricultura de EE.UU.

En el Laboratorio de Requisitos y Funcionamiento de Nutrientes, Dawson y el microbiólogo Joseph Urban desarrollan ensayos moleculares sensibles para los genes citocines y receptores asociados con la nutrición y la inmunidad a los alérgenos alimentarios que amenazan la salud humana.

La base de datos acerca de los cerdos es única porque conecta la expresión de los genes con el funcionamiento de genes y la identificación de vías genéticas relacionadas. También, la información de la base de datos puede ser coordinada con otras bases de datos relacionadas a la genética funcional de humanos y ratones. La base de datos contiene información acerca de 385 herramientas validadas de identificación de impresiones dactilares genéticas, llamadas ensayos de reacción en cadena de la polimerasa (PCR por sus siglas en inglés) en tiempo real, así como 440 otros ensayos de PCR en tiempo real que están en curso de validación. También contiene un catálogo extenso de los anticuerpos antiporcinos con enlaces a la literatura de referencia y vendedores.

Estos ensayos actualmente son usados por más de una docena de laboratorios mundialmente. El lanzamiento de la base de datos facilitará significativamente el uso global de los cerdos como una herramienta importante de investigación biomédica y solidificará el papel del ARS como un líder en los estudios de la inmunidad básica en los cerdos relacionada a la nutrición.