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ARS tuvo un papel clave en el proyecto de secuenciar DNA de un microbio dañoso / 18 de agosto 2003 / Noticias del Servicio de Investigación Agrícola, USDA

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Foto: Tomates.

 

ARS tuvo un papel clave en el proyecto de secuenciar DNA de un microbio dañoso

Por Luis Pons
18 de agosto 2003

El Servicio de Investigación Agrícola (ARS) fue uno de varias instituciones que participaron en un proyecto reciente de secuenciar el genoma de un microbio que infecta plantas de tomate y que sus parientes cercanos afectan muchas otras cosechas.

El secuenciar de la raza de Pseudomonas syringae que causa la enfermedad del moteado bacteriano en plantas de tomate, fue dirigido por científicos en la Universidad Cornell en Ithaca, Nueva York, y el Instituto para Investigaciones Genómicas en Rockville, Maryland. Financiado por la Fundación Nacional de la Ciencia en Arlington, Virginia, el proyecto está siendo demostrado en Internet hoy en la revista 'Proceedings of the National Academy of Sciences' (Procedimientos de la Academia Nacional de Ciencias).

El biólogo molecular Samuel W. Cartinhour y el biólogo computacional David J. Schneider del ARS contribuyeron al esfuerzo colectivo. Cartinhour y Schneider trabajan en el Laboratorio de EE.UU. para Investigaciones Sobre las Plantas, el Suelo y la Nutrición, mantenido por ARS en Ithaca. Su análisis computacional de los datos acerca de la secuencia genómica ayudó al grupo de investigación a desarrollar hallazgos preliminares acerca de las funciones de los más de 5.500 genes en P. syringae, incluyendo indicios de como el microbio infecta las plantas.

Los científicos del ARS examinaron la secuencia para identificar una colección de "temas" del DNA, conocidos como "cajas hrp", que tienen un papel importante en la activación de los genes implicados en enfermedades de plantas. También han identificado un grupo de proteínas, conocidas como "efectores", que se transportan de P. syringae hacia el interior de las células de plantas durante infección de la planta.

Mientras que la raza secuenciada de P. syringae primariamente afecta los tomates, también infecta Arabidopsis thaliana. Ese miembro pequeño y floreciente de la familia de la mostaza (Brassicaceae) es usado comúnmente como un organismo modelo en la biología de plantas. En consecuencia, la raza secuenciada crea un par modelo para los estudios de patógenos de plantas.

Adicionalmente, el microbio P. syringae es estrechamente relacionado con P. aeruginosa, que puede infectar humanos y animales, y con P. putida, una bacteria que se puede usar en la limpieza ambiental. P. syringae también tiene un mecanismo clave de infección en común con otras bacterias que infectan plantas.

El Instituto Boyce Thompson para Investigación en Plantas, ubicado en Ithaca, y la Universidad de Nebraska, la Universidad de Misurí, y la Universidad Estatal de Kansas también participaron en el proyecto.

ARS es la agencia principal de investigaciones científicas del Departamento de Agricultura de EE.UU.

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Última Modificación: 8/18/2003
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